Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm5715-201ENSMUST00000196854 1465 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm44587-201ENSMUST00000207399 1685 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 AC159326.1-201ENSMUST00000219989 1302 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm5117-201ENSMUST00000178878 2553 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Olfr129-202ENSMUST00000216476 5275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 AI481877-201ENSMUST00000107547 4664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
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Rpusd3Q14AI6 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Lair1-201ENSMUST00000068865 6828 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Zfp950-204ENSMUST00000143264 4825 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r39-207ENSMUST00000228862 2398 ntAPPRIS P2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gabrg2-203ENSMUST00000109290 2868 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm26067-201ENSMUST00000103789 110 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Dbi-202ENSMUST00000112648 504 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Spin2d-201ENSMUST00000114517 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
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Rpusd3Q14AI6 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm14871-201ENSMUST00000119056 194 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm11742-201ENSMUST00000119903 233 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm13489-201ENSMUST00000121234 971 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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Rpusd3Q14AI6 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm13773-201ENSMUST00000156693 583 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm24295-201ENSMUST00000158298 131 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Olfr762-ps1-201ENSMUST00000172948 927 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Mir3080-201ENSMUST00000175010 79 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm21882-201ENSMUST00000178332 1083 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Mir7087-201ENSMUST00000184840 70 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Rhoay-ps2-201ENSMUST00000186362 581 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm2325-201ENSMUST00000186637 581 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm6137-201ENSMUST00000187552 578 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm19002-201ENSMUST00000192649 1012 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Mir409-201ENSMUST00000198153 79 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm43093-201ENSMUST00000202439 1213 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm7688-201ENSMUST00000212857 337 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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Rpusd3Q14AI6 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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Rpusd3Q14AI6 Prune2-201ENSMUST00000087689 12512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r43-204ENSMUST00000226983 12805 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm43845-201ENSMUST00000202462 1820 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm5796-201ENSMUST00000096184 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
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Rpusd3Q14AI6 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm1720-201ENSMUST00000135086 1503 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
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Rpusd3Q14AI6 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
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Rpusd3Q14AI6 Gm13887-201ENSMUST00000119009 344 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
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Rpusd3Q14AI6 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 2010013B24Rik-201ENSMUST00000126922 747 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
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Rpusd3Q14AI6 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm20767-201ENSMUST00000179071 510 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm45171-201ENSMUST00000206360 736 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 AC112956.1-201ENSMUST00000213563 492 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 AC123064.2-201ENSMUST00000217758 193 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 AC166358.9-201ENSMUST00000220653 375 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm7768-201ENSMUST00000222988 597 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 AC154436.2-201ENSMUST00000227408 208 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Olfr16-201ENSMUST00000038432 1050 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gda-202ENSMUST00000121725 2450 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
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