Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Fbxl5-203ENSMUST00000114047 2762 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm43886-201ENSMUST00000205039 2386 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 1700097M23Rik-201ENSMUST00000204079 1522 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm26655-203ENSMUST00000181095 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm26680-203ENSMUST00000181701 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm26630-204ENSMUST00000181759 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 AC174797.3-203ENSMUST00000225749 2078 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm16579-201ENSMUST00000161985 2566 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Vezt-201ENSMUST00000047711 4479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Pde10a-204ENSMUST00000115715 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm45221-201ENSMUST00000207822 2272 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm11346-201ENSMUST00000118346 704 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm14731-201ENSMUST00000119216 376 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm12935-201ENSMUST00000119352 246 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm15364-201ENSMUST00000119618 585 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm23118-201ENSMUST00000122657 187 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 4930555B12Rik-201ENSMUST00000135444 283 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm15900-201ENSMUST00000161584 342 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm22584-201ENSMUST00000177935 92 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Mir6989-201ENSMUST00000184812 65 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm28146-201ENSMUST00000185517 701 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm28574-201ENSMUST00000185757 699 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm28397-201ENSMUST00000187970 699 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm29366-201ENSMUST00000190481 699 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm17781-201ENSMUST00000195232 649 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm43043-201ENSMUST00000196579 412 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm35325-201ENSMUST00000208979 771 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 AC166358.3-201ENSMUST00000221456 181 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 AC154271.1-201ENSMUST00000224780 383 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Trmt2b-201ENSMUST00000087540 822 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm44424-201ENSMUST00000203438 1826 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 3110043O21Rik-201ENSMUST00000084724 3413 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm29968-201ENSMUST00000222815 1387 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Ogfod1-201ENSMUST00000060632 5214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Scn11a-201ENSMUST00000070617 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Cacna1c-207ENSMUST00000186889 13162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Olfr374-202ENSMUST00000210435 8718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm37937-201ENSMUST00000194130 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Ccdc162-210ENSMUST00000189488 7260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Tmem161b-201ENSMUST00000057495 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Mlip-215ENSMUST00000185144 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Serpinb3a-201ENSMUST00000027567 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 1110008L16Rik-205ENSMUST00000184766 2250 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Glce-203ENSMUST00000185675 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Olfr859-203ENSMUST00000217280 9596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 AC151984.1-201ENSMUST00000218261 2976 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Zfp111-203ENSMUST00000086006 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Cdh2-202ENSMUST00000115850 3785 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Dock5-201ENSMUST00000039135 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Olfr1480-204ENSMUST00000207987 1804 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Prickle2-204ENSMUST00000113447 7679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Vmn2r50-201ENSMUST00000074943 2586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Dusp3-206ENSMUST00000151678 4084 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm25213-201ENSMUST00000102388 113 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm5483-201ENSMUST00000114858 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm11898-201ENSMUST00000117161 385 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm14292-201ENSMUST00000118761 456 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm12646-201ENSMUST00000119144 238 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm13475-201ENSMUST00000119290 234 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms