Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Klra14-ps-202ENSMUST00000203601 1104 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Cyp2b27-ps-201ENSMUST00000205582 1279 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Gm45200-201ENSMUST00000207434 919 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Gm33601-201ENSMUST00000210001 961 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Mir670hg-207ENSMUST00000211619 819 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SgcdP82347 AC122332.1-201ENSMUST00000214384 285 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SgcdP82347 AC166358.4-201ENSMUST00000223030 105 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Agr3-201ENSMUST00000042101 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SgcdP82347 4930578G10Rik-201ENSMUST00000068158 614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Olfr1261-201ENSMUST00000077785 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Mir143-201ENSMUST00000083511 63 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Mir129-2-201ENSMUST00000083577 90 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Tom1l1-204ENSMUST00000107869 1826 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Vmn1r43-204ENSMUST00000226983 12805 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Ccr5-202ENSMUST00000111442 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Gm43027-201ENSMUST00000202906 3691 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Gm37529-201ENSMUST00000195618 4321 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Olfr995-202ENSMUST00000216933 1706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Acsm3-204ENSMUST00000106528 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Klhl28-203ENSMUST00000222508 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Gm43175-201ENSMUST00000198450 3810 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Olfr1085-203ENSMUST00000214566 5129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Olfr1303-202ENSMUST00000216114 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Gm8989-201ENSMUST00000184782 7275 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Gm13321-201ENSMUST00000117101 400 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Gm14985-201ENSMUST00000118693 786 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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SgcdP82347 Gm25439-201ENSMUST00000158280 131 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Gm22261-201ENSMUST00000158691 324 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Gm20069-201ENSMUST00000178938 545 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Gm26983-201ENSMUST00000182051 388 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Vis1-201ENSMUST00000183957 201 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Gm37908-201ENSMUST00000195828 470 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Gm6828-201ENSMUST00000207902 1186 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Olfr200-ps1-201ENSMUST00000207964 874 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 4930505K13Rik-201ENSMUST00000208641 546 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Gm44516-201ENSMUST00000208794 833 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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SgcdP82347 AC134537.2-201ENSMUST00000217770 575 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 AC154335.1-201ENSMUST00000224744 395 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 AC123665.6-201ENSMUST00000228568 538 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Olfr509-201ENSMUST00000061690 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Serpinb9d-201ENSMUST00000067198 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Stxbp3-ps-201ENSMUST00000090527 758 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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SgcdP82347 AC155941.5-201ENSMUST00000218925 1505 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Ino80d-205ENSMUST00000165066 13529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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SgcdP82347 Ndst4-205ENSMUST00000174648 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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SgcdP82347 Gm43258-201ENSMUST00000200312 1950 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Gm37569-201ENSMUST00000192111 1722 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Prrc2c-210ENSMUST00000182660 11502 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Inpp4b-209ENSMUST00000172031 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Il1rapl2-201ENSMUST00000075471 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Olfr767-202ENSMUST00000213579 5493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Olfr427-202ENSMUST00000213832 3866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Stard9-207ENSMUST00000180041 15102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SgcdP82347 1810018F18Rik-203ENSMUST00000189764 1325 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Gm43011-201ENSMUST00000197897 4433 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Slc10a2-201ENSMUST00000023835 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Gm42662-201ENSMUST00000202539 1431 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SgcdP82347 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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