Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Vmn2r3-201ENSMUST00000170244 2670 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Elavl2-202ENSMUST00000102799 3840 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Serpinb5-202ENSMUST00000112729 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Stag2-202ENSMUST00000115072 5955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Irx1P81068 AC162938.2-205ENSMUST00000217551 2828 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Irx1P81068 4932438A13Rik-217ENSMUST00000152564 15541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Gm15772-201ENSMUST00000118533 438 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Gm12267-201ENSMUST00000121609 761 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Irx1P81068 n-R5s21-201ENSMUST00000122692 117 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Gm25430-201ENSMUST00000157614 289 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Gm25906-201ENSMUST00000158489 126 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Isx-202ENSMUST00000174427 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Trav12n-3-201ENSMUST00000179583 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Gm38015-201ENSMUST00000193048 188 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Mirlet7e-201ENSMUST00000196737 93 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Gm4714-201ENSMUST00000203395 279 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Gm44795-201ENSMUST00000205496 319 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Irx1P81068 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Gm26522-201ENSMUST00000181565 1555 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Glcci1-206ENSMUST00000162567 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Rgs21-202ENSMUST00000184189 1674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Fbxl13-202ENSMUST00000115234 2143 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Scel-201ENSMUST00000095576 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Brcc3-202ENSMUST00000114074 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Nxf3-201ENSMUST00000080929 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Olfr291-202ENSMUST00000217039 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Gm42729-201ENSMUST00000201770 2930 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Olfr690-203ENSMUST00000216230 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Zfp644-203ENSMUST00000112695 1915 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Gm37690-202ENSMUST00000192684 1497 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Agxt2-203ENSMUST00000110541 1222 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Gm12650-201ENSMUST00000121966 258 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Gm22958-201ENSMUST00000122512 184 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Gm21990-201ENSMUST00000124692 383 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Gm15818-201ENSMUST00000134692 656 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Gtsf1-205ENSMUST00000141364 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Gm15600-201ENSMUST00000153522 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Gm24216-201ENSMUST00000158259 117 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 AC122858.3-202ENSMUST00000161721 433 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Vmn1r-ps66-201ENSMUST00000173436 612 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Gm21917-201ENSMUST00000177831 666 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Cox6b2-209ENSMUST00000184143 435 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Gm18698-201ENSMUST00000192327 668 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Chaer1-201ENSMUST00000201649 651 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 4930500F04Rik-202ENSMUST00000202156 251 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Minpp1-ps-201ENSMUST00000203344 946 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Gm45169-201ENSMUST00000205717 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Gm44820-201ENSMUST00000207420 396 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Gm7435-201ENSMUST00000214039 486 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Gm18705-201ENSMUST00000215985 913 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 AC119892.1-201ENSMUST00000217997 384 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 AC122858.3-201ENSMUST00000226341 740 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 AC124408.2-201ENSMUST00000228168 645 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 AC122858.1-202ENSMUST00000228290 986 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 AC123665.4-201ENSMUST00000228790 249 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Mup14-201ENSMUST00000071005 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Olfr739-201ENSMUST00000075261 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Mir218-2-201ENSMUST00000083649 110 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Vmn1r209-203ENSMUST00000227265 6550 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Hrnr-202ENSMUST00000093774 11187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Olfr657-202ENSMUST00000213297 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Zfp715-202ENSMUST00000048015 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Irx1P81068 5730408A14Rik-201ENSMUST00000194955 1824 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Gm37461-201ENSMUST00000193929 3704 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Vmn2r4-201ENSMUST00000170280 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Olfr1382-202ENSMUST00000213152 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Cdh12-203ENSMUST00000227496 6004 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Irx1P81068 4932411K12Rik-203ENSMUST00000210384 1351 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Btf3l4-204ENSMUST00000102742 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Olfr715b-202ENSMUST00000215713 3879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Vmn1r217-202ENSMUST00000227110 9888 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Mup-ps19-201ENSMUST00000120390 519 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Irx1P81068 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Tnfsf13os-202ENSMUST00000144033 578 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Gm14246-201ENSMUST00000155173 680 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Mrgprc3-ps-201ENSMUST00000189876 955 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Irx1P81068 Gm2979-201ENSMUST00000193442 463 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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