Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gm14902-201ENSMUST00000145576 1007 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Irx2P81066 E130111B04Rik-201ENSMUST00000156781 450 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Irx2P81066 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Irx2P81066 Gm24498-201ENSMUST00000158445 102 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Irx2P81066 Gm15257-201ENSMUST00000177680 883 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Irx2P81066 Gm15252-201ENSMUST00000177750 883 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Irx2P81066 Gm15256-201ENSMUST00000177793 883 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Irx2P81066 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Irx2P81066 Gm15260-201ENSMUST00000179402 883 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Irx2P81066 Gm26877-201ENSMUST00000180728 633 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Irx2P81066 Serpinb10-202ENSMUST00000182198 1265 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Irx2P81066 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Irx2P81066 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Irx2P81066 Gm27596-201ENSMUST00000185061 83 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Irx2P81066 Gm29484-201ENSMUST00000186067 324 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Irx2P81066 Gm5692-201ENSMUST00000187254 1057 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Irx2P81066 Gm29007-201ENSMUST00000190633 679 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Irx2P81066 Gm37177-201ENSMUST00000193768 417 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Irx2P81066 C230071H17Rik-201ENSMUST00000196044 2973 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Irx2P81066 Gm43582-201ENSMUST00000196149 343 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Irx2P81066 Gm43304-201ENSMUST00000196803 326 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Irx2P81066 Gm20940-201ENSMUST00000197308 360 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Irx2P81066 Gm43659-201ENSMUST00000200894 628 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Irx2P81066 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Irx2P81066 Snhg1-207ENSMUST00000205909 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Irx2P81066 1700034P13Rik-206ENSMUST00000207445 1146 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Irx2P81066 Gm6362-201ENSMUST00000217686 836 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Irx2P81066 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Irx2P81066 AV026068-224ENSMUST00000224827 928 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Irx2P81066 AC156790.3-201ENSMUST00000226200 254 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Irx2P81066 AC130673.2-201ENSMUST00000228091 797 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Irx2P81066 AC127371.1-201ENSMUST00000228516 312 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Irx2P81066 4933430A20Rik-201ENSMUST00000210943 1558 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Txlng-202ENSMUST00000112314 3348 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Gm44886-201ENSMUST00000209009 1304 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Irx2P81066 6720464F23Rik-201ENSMUST00000193946 3496 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Olfr765-202ENSMUST00000216460 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Irx2P81066 AC159476.1-201ENSMUST00000215914 1668 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Irx2P81066 AC139218.1-201ENSMUST00000228215 4287 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Gm12800-201ENSMUST00000075999 1455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Zfp780b-204ENSMUST00000206685 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Gm16421-201ENSMUST00000117616 1557 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Olfr1311-203ENSMUST00000215321 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Vmn1r124-201ENSMUST00000105200 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Gm10563-201ENSMUST00000115821 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Gm12225-201ENSMUST00000117995 298 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 1700036O09Rik-201ENSMUST00000136834 349 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Gm22915-201ENSMUST00000157615 136 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Gm23354-201ENSMUST00000158426 104 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Gm25348-201ENSMUST00000158961 111 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Gm16243-201ENSMUST00000160351 494 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Vmn2r-ps84-201ENSMUST00000173377 897 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Lgals1-ps1-201ENSMUST00000173500 368 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Vmn1r-ps11-201ENSMUST00000176097 853 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Vmn2r-ps10-201ENSMUST00000176836 898 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Vmn2r-ps8-201ENSMUST00000177088 898 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Vmn1r148-201ENSMUST00000177774 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Vmn1r100-201ENSMUST00000177815 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Ear1-202ENSMUST00000179200 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 1700016P04Rik-201ENSMUST00000186770 429 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Gm18150-201ENSMUST00000195341 645 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Gm43841-201ENSMUST00000199491 586 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 8030487O14Rik-201ENSMUST00000200244 903 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Gm44261-201ENSMUST00000203337 209 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Klrb1b-204ENSMUST00000205130 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Gm31897-201ENSMUST00000205924 340 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Gm44690-201ENSMUST00000207984 382 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Gm19196-201ENSMUST00000209258 357 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 AL929417.1-201ENSMUST00000214901 124 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 CT030242.3-201ENSMUST00000221231 581 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 AC165260.3-201ENSMUST00000225101 665 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 CT030254.3-201ENSMUST00000225959 1231 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 AC115304.1-202ENSMUST00000226850 837 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Agr3-201ENSMUST00000042101 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Olfr846-201ENSMUST00000078774 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 n-R5s3-201ENSMUST00000083879 112 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Gm13304-201ENSMUST00000098123 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Olfr1101-201ENSMUST00000099870 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Gm45854-201ENSMUST00000211857 3488 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Gm43528-201ENSMUST00000199492 1674 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Olfr149-202ENSMUST00000215192 2806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Gm7754-201ENSMUST00000223075 2064 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Irx2P81066 CT025710.1-201ENSMUST00000222949 2533 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms