Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm20667-201ENSMUST00000175674 1930 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gucy2f-201ENSMUST00000042530 8122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Uty-204ENSMUST00000139365 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Ighv1-20-201ENSMUST00000103506 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Mir292-201ENSMUST00000104847 82 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm12110-201ENSMUST00000121601 579 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 5330429C05Rik-201ENSMUST00000154615 487 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm4831-201ENSMUST00000174626 594 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm23633-201ENSMUST00000175293 119 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Obox4-ps38-201ENSMUST00000175961 724 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Mir7037-201ENSMUST00000184414 65 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm37235-201ENSMUST00000195171 59 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm38008-201ENSMUST00000195333 518 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Ube2l3-ps1-201ENSMUST00000199777 436 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm31698-203ENSMUST00000217115 690 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm6906-201ENSMUST00000218014 569 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 AC159293.2-201ENSMUST00000222289 424 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 CT010575.2-201ENSMUST00000222876 496 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Olfr1406-201ENSMUST00000072395 1063 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Olfr1261-201ENSMUST00000077785 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm22971-201ENSMUST00000083305 97 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Serpinb5-202ENSMUST00000112729 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm38125-201ENSMUST00000194136 3438 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm42548-201ENSMUST00000202669 3933 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Cd180-201ENSMUST00000022124 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm13590-201ENSMUST00000120183 1588 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Vmn2r60-201ENSMUST00000166447 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 4930579C12Rik-202ENSMUST00000187015 3676 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm12051-201ENSMUST00000147771 1341 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Plcz1-201ENSMUST00000032356 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Olfr590-ps1-201ENSMUST00000118801 898 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm14335-201ENSMUST00000119165 810 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm16423-201ENSMUST00000120078 947 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm13363-201ENSMUST00000122008 522 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 1700048M11Rik-201ENSMUST00000132861 485 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Olfr102-201ENSMUST00000169373 1027 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm20417-201ENSMUST00000174784 425 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm45185-201ENSMUST00000207556 404 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm44554-201ENSMUST00000208738 147 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm8189-203ENSMUST00000211159 1225 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 AC159819.1-201ENSMUST00000213911 328 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Rpl17-ps2-201ENSMUST00000218101 532 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 AC153937.2-201ENSMUST00000218485 632 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 AC168056.2-201ENSMUST00000223591 269 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 AC165437.1-201ENSMUST00000228640 536 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Olfr734-201ENSMUST00000050928 1033 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Olfr476-201ENSMUST00000077249 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Phf11c-201ENSMUST00000166912 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Vmn1r1-202ENSMUST00000227586 3766 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm17752-201ENSMUST00000185787 3726 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Zfp607a-203ENSMUST00000205715 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Ocrl-202ENSMUST00000115013 2910 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Vmn1r209-203ENSMUST00000227265 6550 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Olfr1097-202ENSMUST00000217403 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Olfr535-207ENSMUST00000217235 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm13084-201ENSMUST00000075045 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Zfp458-204ENSMUST00000225772 3485 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Cdk14-203ENSMUST00000115451 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Obox7-203ENSMUST00000183788 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm3665-201ENSMUST00000177214 2461 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps51-201ENSMUST00000177271 2461 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Mtm1-213ENSMUST00000171933 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm15233-201ENSMUST00000118747 400 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm14434-201ENSMUST00000120521 559 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm17216-201ENSMUST00000130872 728 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm14410-202ENSMUST00000133301 1113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms