Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm6650-201ENSMUST00000166710 614 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Lgals1-ps1-201ENSMUST00000173500 368 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm8993-201ENSMUST00000182182 983 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Chd1P40201 9130024F11Rik-203ENSMUST00000187858 447 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Olfr48-202ENSMUST00000214428 3848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm32171-201ENSMUST00000217419 1043 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Chd1P40201 AC154358.1-201ENSMUST00000224871 218 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Pcdh19-203ENSMUST00000167944 8407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Xlr3c-201ENSMUST00000080839 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Olfr1352-201ENSMUST00000058991 4356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Maml2-203ENSMUST00000177755 2264 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm24935-201ENSMUST00000103770 110 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm14107-201ENSMUST00000117774 330 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm12252-201ENSMUST00000119517 219 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Sox5os5-201ENSMUST00000152192 207 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Stk31-202ENSMUST00000163954 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm18016-201ENSMUST00000216119 801 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm30034-201ENSMUST00000219589 248 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 AC154592.1-201ENSMUST00000225784 574 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Olfr99-201ENSMUST00000077585 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 3110043O21Rik-201ENSMUST00000084724 3413 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 G630018N14Rik-203ENSMUST00000221171 5888 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm37606-201ENSMUST00000191816 3116 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Abcc9-202ENSMUST00000087527 6213 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Pcdh9-204ENSMUST00000193901 6127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 AC144772.1-201ENSMUST00000226372 2398 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Nav1-201ENSMUST00000040599 12767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Txndc8-201ENSMUST00000102897 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm22473-201ENSMUST00000104114 132 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm13132-201ENSMUST00000121194 472 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 n-R5s21-201ENSMUST00000122692 117 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm16558-201ENSMUST00000163015 532 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm17152-201ENSMUST00000172430 535 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Hcfc1r1-ps2-201ENSMUST00000199379 339 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm4501-201ENSMUST00000207330 551 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm4558-201ENSMUST00000207886 521 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 AC159821.1-201ENSMUST00000214934 248 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm18940-201ENSMUST00000222518 871 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 AC164618.1-201ENSMUST00000225769 592 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Cd59b-201ENSMUST00000090429 796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Dixdc1-201ENSMUST00000034566 5709 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Rp1-201ENSMUST00000027032 6869 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Ktn1-215ENSMUST00000189101 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Phyhipl-206ENSMUST00000162251 1540 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Mup-ps17-201ENSMUST00000120723 218 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Mir5134-201ENSMUST00000175529 78 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Gm21320-201ENSMUST00000211875 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Gm7807-201ENSMUST00000212475 578 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Olfr437-201ENSMUST00000060243 1018 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Chd1P40201 BC048502-201ENSMUST00000065978 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Chd1P40201 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Hyal5-201ENSMUST00000031689 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Gm43121-201ENSMUST00000199065 1305 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Olfr373-203ENSMUST00000215198 3923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Vmn1r5-202ENSMUST00000226130 3393 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Gm43485-201ENSMUST00000199292 1710 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Olfr1324-202ENSMUST00000215270 5679 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Gm14393-202ENSMUST00000109066 564 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Gm14067-201ENSMUST00000119340 314 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Gm15350-201ENSMUST00000135138 569 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Obox1-205ENSMUST00000173443 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Obox2-204ENSMUST00000174305 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Mir8097-201ENSMUST00000185150 119 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Gm8790-201ENSMUST00000194108 322 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Klrb1b-204ENSMUST00000205130 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Chd1P40201 AC153526.4-201ENSMUST00000217713 379 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Chd1P40201 AC154371.1-201ENSMUST00000226600 412 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Gm22868-201ENSMUST00000083955 164 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.8 ms