Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Tbx20-201ENSMUST00000052946 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprkP35822 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm4166-201ENSMUST00000220893 2996 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Dnah9-201ENSMUST00000080665 13798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Olfr1305-202ENSMUST00000213405 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Akr1c14-202ENSMUST00000118717 3183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm3086-201ENSMUST00000110560 620 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Rps19-ps7-201ENSMUST00000116122 438 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm12717-201ENSMUST00000118427 983 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm12231-201ENSMUST00000119447 695 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprkP35822 n-R5s21-201ENSMUST00000122692 117 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm14410-202ENSMUST00000133301 1113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm25907-201ENSMUST00000158486 125 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm11007-201ENSMUST00000177700 195 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm2007-201ENSMUST00000177981 195 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm2004-203ENSMUST00000179349 195 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm28786-201ENSMUST00000187228 172 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Pinc-202ENSMUST00000190487 961 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm37123-201ENSMUST00000192994 1171 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprkP35822 AC154283.1-201ENSMUST00000228417 389 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm3896-201ENSMUST00000176020 4094 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Vsig4-201ENSMUST00000050707 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Trim12c-201ENSMUST00000059037 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm43283-201ENSMUST00000199138 2548 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm15779-201ENSMUST00000117470 412 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Olfr1149-ps1-201ENSMUST00000118232 691 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm14933-201ENSMUST00000118840 481 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Itpa-ps3-201ENSMUST00000119034 395 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm11931-201ENSMUST00000121630 447 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm14095-201ENSMUST00000134264 516 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprkP35822 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm38825-201ENSMUST00000204022 648 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm4501-201ENSMUST00000207330 551 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm4558-201ENSMUST00000207886 521 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Olfr1297-201ENSMUST00000099612 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprkP35822 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Xpo7-203ENSMUST00000226448 3663 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprkP35822 P2ry12-202ENSMUST00000170388 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm44171-201ENSMUST00000203701 2109 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprkP35822 AC124569.3-201ENSMUST00000224860 1621 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprkP35822 4930435E12Rik-201ENSMUST00000122078 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Pof1b-201ENSMUST00000039887 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Cyp3a57-201ENSMUST00000079268 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprkP35822 AI987944-202ENSMUST00000205338 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprkP35822 4932414N04Rik-204ENSMUST00000128259 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Olfr1252-202ENSMUST00000213196 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprkP35822 A730081D07Rik-201ENSMUST00000153685 1804 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Lypd6-205ENSMUST00000169232 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Txndc8-201ENSMUST00000102897 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm24935-201ENSMUST00000103770 110 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm13220-201ENSMUST00000121535 508 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm2165-201ENSMUST00000124609 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm14553-201ENSMUST00000126711 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm2101-204ENSMUST00000137421 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm3669-205ENSMUST00000144018 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm28039-201ENSMUST00000149128 254 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm15740-201ENSMUST00000159703 1292 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm1992-201ENSMUST00000161581 250 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprkP35822 A930005H10Rik-202ENSMUST00000185424 433 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm37712-201ENSMUST00000194295 647 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Ssxb3-202ENSMUST00000089379 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprkP35822 AC120347.1-201ENSMUST00000223326 1639 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm4922-201ENSMUST00000055107 1950 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Ak9-201ENSMUST00000173494 6968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm44742-201ENSMUST00000207190 1412 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Vmn2r5-201ENSMUST00000170270 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm24982-201ENSMUST00000104456 132 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
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