Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Gm28266-201ENSMUST00000191410 439 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Gm43574-201ENSMUST00000196226 809 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Gm45044-201ENSMUST00000208078 396 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Gm45646-201ENSMUST00000210983 441 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 AL669916.5-201ENSMUST00000214874 361 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 AC135019.1-201ENSMUST00000219949 307 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Gm46993-201ENSMUST00000220708 259 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 AC139750.2-201ENSMUST00000224424 386 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Pgbd1-205ENSMUST00000151743 2642 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Lepr-201ENSMUST00000037552 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 AC154828.1-201ENSMUST00000220696 2810 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Ank3-202ENSMUST00000054167 5769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Il31ra-206ENSMUST00000224510 2946 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Olfr180-203ENSMUST00000206168 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Erg-202ENSMUST00000113846 3249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Lcorl-201ENSMUST00000016026 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Olfr812-203ENSMUST00000205013 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Senp6-203ENSMUST00000165607 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Sox2ot-215ENSMUST00000199171 3486 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Slc34a1-205ENSMUST00000225259 3983 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Glt8d2-201ENSMUST00000020485 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Gm9125-201ENSMUST00000178458 2233 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Gm1698-201ENSMUST00000136749 2313 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Serpina7-201ENSMUST00000033626 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Vmn2r-ps96-201ENSMUST00000221218 2545 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Hnrnpk-205ENSMUST00000176207 2653 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Gm2163-201ENSMUST00000179734 2723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Cpsf2-201ENSMUST00000047357 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Gm26656-201ENSMUST00000181825 2972 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Cux1-201ENSMUST00000004097 12862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Grip1-210ENSMUST00000144825 3250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 A830036E02Rik-204ENSMUST00000139095 3413 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Net1-202ENSMUST00000099946 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Rtel1-202ENSMUST00000054622 4401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Luzp2-201ENSMUST00000082373 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Slc38a1-203ENSMUST00000100262 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Pramef25-201ENSMUST00000105766 1684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Gm14628-201ENSMUST00000117508 635 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Gm11409-201ENSMUST00000118621 403 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Tpt1-ps3-201ENSMUST00000121046 519 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Gm12478-201ENSMUST00000127709 353 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 4930505K14Rik-201ENSMUST00000155504 515 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Gm16569-201ENSMUST00000160526 314 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Coq8a-217ENSMUST00000170472 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Gm27028-201ENSMUST00000182303 399 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Gm7656-201ENSMUST00000182468 1004 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Mir6926-201ENSMUST00000184562 68 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Gm27747-201ENSMUST00000184707 85 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Gsdmc4-202ENSMUST00000188108 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Gm29192-201ENSMUST00000190942 377 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Gm37769-201ENSMUST00000193753 2369 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Gm29813-201ENSMUST00000195856 447 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Gm43968-201ENSMUST00000203388 389 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Gm44157-201ENSMUST00000204720 410 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Gm44002-201ENSMUST00000205134 594 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Gm44795-201ENSMUST00000205496 319 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Gm45173-201ENSMUST00000206819 305 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Olfr919-202ENSMUST00000215612 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Gm5654-201ENSMUST00000217787 475 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 RMST_1.1-209ENSMUST00000219444 2679 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 AC156025.3-201ENSMUST00000225919 3095 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Alpk1-201ENSMUST00000029662 4795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Mbd4-201ENSMUST00000032469 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Cdip1-201ENSMUST00000004173 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 mt-Nd4l-201ENSMUST00000084013 297 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Phc3-203ENSMUST00000099163 2808 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Nhsl2-201ENSMUST00000101339 12971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Zfp40-201ENSMUST00000037057 4103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Nlrp3-201ENSMUST00000079476 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Ap3b2-201ENSMUST00000082090 3804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Olfr523-202ENSMUST00000209314 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Trpm3-206ENSMUST00000099569 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb4P10284 Gm12661-201ENSMUST00000118780 3335 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms