Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm14362-201ENSMUST00000121679 273 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm9225-201ENSMUST00000121921 836 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm16254-201ENSMUST00000131528 730 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm15254-201ENSMUST00000149567 273 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm9071-201ENSMUST00000165915 474 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Fcf1-202ENSMUST00000171040 731 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm4134-201ENSMUST00000173244 563 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm28141-201ENSMUST00000186676 342 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm29556-201ENSMUST00000187591 696 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm19029-201ENSMUST00000189923 564 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Obox4-ps32-201ENSMUST00000196512 537 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm43510-201ENSMUST00000197922 353 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm19147-201ENSMUST00000199622 652 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm44040-201ENSMUST00000203360 545 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Klk1b23-ps-201ENSMUST00000206347 345 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm7753-201ENSMUST00000221007 867 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 AC132112.1-201ENSMUST00000226354 505 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 AC154598.1-201ENSMUST00000227079 347 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Olfr39-201ENSMUST00000071725 1098 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm15681-201ENSMUST00000137501 2704 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Kmo-201ENSMUST00000040250 2695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gcnt2-202ENSMUST00000069958 3929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Mei1-204ENSMUST00000189540 3718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm26655-203ENSMUST00000181095 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm26680-203ENSMUST00000181701 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm26630-204ENSMUST00000181759 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 AC174797.3-203ENSMUST00000225749 2078 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Olfr1257-202ENSMUST00000111519 2756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Olfr1026-202ENSMUST00000217615 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Fbxw28-201ENSMUST00000112039 1497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm43886-201ENSMUST00000205039 2386 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Olfr726-206ENSMUST00000217025 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm10319-201ENSMUST00000078431 1355 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Ppih-202ENSMUST00000106317 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Eif3s6-ps1-201ENSMUST00000117907 470 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm13503-201ENSMUST00000119017 446 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm13013-201ENSMUST00000119087 523 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm12267-201ENSMUST00000121609 761 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 5730412P04Rik-201ENSMUST00000147100 1149 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm24534-201ENSMUST00000157949 291 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm23542-201ENSMUST00000158208 96 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm3084-201ENSMUST00000169967 598 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm24812-201ENSMUST00000175315 284 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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