Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm7721-201ENSMUST00000200446 546 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm32453-201ENSMUST00000204183 456 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Olfr1295-201ENSMUST00000207283 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm19201-201ENSMUST00000210127 778 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 AC112956.1-201ENSMUST00000213563 492 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 AC142273.1-201ENSMUST00000213723 673 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 AC160635.2-201ENSMUST00000216368 734 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Olfr1092-ps1-201ENSMUST00000216544 398 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 AC132121.1-201ENSMUST00000220774 332 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm40653-202ENSMUST00000222122 1155 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 AC132317.2-201ENSMUST00000227301 519 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Olfr346-201ENSMUST00000078854 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Olfr206-201ENSMUST00000084791 1005 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Olfr1143-201ENSMUST00000090708 945 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Cyp4a31-201ENSMUST00000030480 2396 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Serpinb5-202ENSMUST00000112729 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Vmn1r189-202ENSMUST00000227357 3245 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Vmn1r189-203ENSMUST00000228428 3231 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm37514-201ENSMUST00000194512 2753 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Zfp280c-201ENSMUST00000072292 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Igsf10-201ENSMUST00000039419 10084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 4932411N23Rik-201ENSMUST00000081074 3407 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm44724-201ENSMUST00000207119 5548 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Igkv15-103-201ENSMUST00000103324 375 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm13023-202ENSMUST00000105770 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm12423-201ENSMUST00000118334 135 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm14871-201ENSMUST00000119056 194 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm11805-201ENSMUST00000121238 600 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm11200-201ENSMUST00000121698 448 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm22958-201ENSMUST00000122512 184 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 A230083N12Rik-201ENSMUST00000126646 572 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm16259-201ENSMUST00000145241 553 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm26046-201ENSMUST00000157312 166 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm16557-201ENSMUST00000159182 191 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm6619-201ENSMUST00000159229 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 5430401F13Rik-202ENSMUST00000161385 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Iltifb-201ENSMUST00000163808 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm3727-201ENSMUST00000168458 995 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm27225-201ENSMUST00000183833 557 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm2497-201ENSMUST00000189539 601 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 1700052I22Rik-201ENSMUST00000190431 379 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Ighv6-2-201ENSMUST00000192430 295 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm37187-201ENSMUST00000193425 341 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm37681-201ENSMUST00000193880 727 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm37908-201ENSMUST00000195828 470 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm43054-201ENSMUST00000199495 884 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm19617-201ENSMUST00000202977 308 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Minpp1-ps-201ENSMUST00000203344 946 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 AC151971.3-201ENSMUST00000214694 404 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 AC211878.5-201ENSMUST00000221697 409 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 AC154840.1-201ENSMUST00000225216 408 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 AC121912.1-201ENSMUST00000227525 1201 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Olfr1302-201ENSMUST00000054004 948 ntAPPRIS P2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm14393-201ENSMUST00000072895 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 5430401F13Rik-201ENSMUST00000075020 602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm23972-201ENSMUST00000083322 165 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Olfr1407-ps1-201ENSMUST00000085885 797 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Vmn1r197-203ENSMUST00000227017 5158 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Ago2-201ENSMUST00000044113 13705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Nlrp4f-204ENSMUST00000221659 3551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Olfr481-202ENSMUST00000213601 5247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Btbd35f13-201ENSMUST00000177912 1701 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Olfr447-202ENSMUST00000216408 3185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Postn-201ENSMUST00000073012 3189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Olfr685-203ENSMUST00000214712 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Olfr560-201ENSMUST00000210453 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Clvs1-202ENSMUST00000108348 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Prr11-201ENSMUST00000051395 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm5117-201ENSMUST00000178878 2553 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm37690-202ENSMUST00000192684 1497 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Olfr364-ps1-202ENSMUST00000214905 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 AC123705.3-201ENSMUST00000223531 2069 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Clec2e-201ENSMUST00000032258 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Txndc8-201ENSMUST00000102897 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Traj2-201ENSMUST00000103738 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm13321-201ENSMUST00000117101 400 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm13690-201ENSMUST00000118989 285 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.3 ms