Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 AC102291.1-201ENSMUST00000227164 529 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Olfr654-201ENSMUST00000098173 1155 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Tlr13-201ENSMUST00000040065 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Rgs17-204ENSMUST00000131996 8107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Cyp2c40-201ENSMUST00000160476 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 AC153912.2-201ENSMUST00000215840 2015 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 E330013P04Rik-201ENSMUST00000065383 2070 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Vmn2r95-201ENSMUST00000166327 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm30292-201ENSMUST00000194198 3000 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Cdk14-201ENSMUST00000030763 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Dnah14-209ENSMUST00000208001 13696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Olfr535-203ENSMUST00000213715 5033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Pfkfb2-202ENSMUST00000066863 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Olfr1261-204ENSMUST00000216953 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm42781-201ENSMUST00000201317 2719 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Vmn1r21-201ENSMUST00000203310 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm43485-201ENSMUST00000199292 1710 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 AC131068.3-201ENSMUST00000228438 1456 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Kpna2-202ENSMUST00000106768 541 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm12322-201ENSMUST00000121605 389 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm15762-201ENSMUST00000126447 333 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm16254-201ENSMUST00000131528 730 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm12114-201ENSMUST00000147896 656 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm13662-201ENSMUST00000157059 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Vmn1r101-201ENSMUST00000164245 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Vmn1r119-201ENSMUST00000164683 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Vmn1r149-201ENSMUST00000165916 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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Opn1mwO35599 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Obox4-ps5-201ENSMUST00000196368 397 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Obox4-ps4-201ENSMUST00000196934 397 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Obox4-ps10-201ENSMUST00000199376 504 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm42663-201ENSMUST00000199883 351 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm44585-201ENSMUST00000207150 607 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm6230-201ENSMUST00000208077 780 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 AC164624.1-201ENSMUST00000219148 1025 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 AC123705.4-202ENSMUST00000221602 697 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm40271-201ENSMUST00000221752 422 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 AC154576.2-203ENSMUST00000224736 253 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Meig1-201ENSMUST00000064685 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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Opn1mwO35599 Olfr1314-201ENSMUST00000099598 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Galnt1-208ENSMUST00000178605 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Omd-202ENSMUST00000221170 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Olfr266-202ENSMUST00000213616 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm4922-201ENSMUST00000055107 1950 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Dgkk-201ENSMUST00000067410 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm11290-204ENSMUST00000224688 3042 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm10471-201ENSMUST00000094946 2967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Vmn2r89-202ENSMUST00000159734 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Olfr721-ps1-203ENSMUST00000215479 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Trav15n-1-201ENSMUST00000103590 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm25418-201ENSMUST00000104214 129 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm12641-201ENSMUST00000117874 985 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm11433-201ENSMUST00000118318 228 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm2012-201ENSMUST00000121900 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Xaf1-202ENSMUST00000140842 651 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms