Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Gm16089-201ENSMUST00000117679 336 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Gm12707-201ENSMUST00000155789 489 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Gm24217-201ENSMUST00000158260 133 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Gm16213-201ENSMUST00000160076 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Gm19124-201ENSMUST00000191041 832 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Gm43524-201ENSMUST00000197278 298 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Gm42502-201ENSMUST00000198550 1089 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Gm3816-201ENSMUST00000209803 433 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 AC138284.2-201ENSMUST00000213982 567 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 AC155236.1-201ENSMUST00000220591 923 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Gm46430-203ENSMUST00000221389 1049 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 AC125543.1-201ENSMUST00000222778 101 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 AC133910.1-201ENSMUST00000228128 624 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 AC112142.1-206ENSMUST00000228136 982 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Gm23626-201ENSMUST00000082458 133 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Gm43281-201ENSMUST00000202522 2704 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Gm44250-201ENSMUST00000203092 4229 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Gm14296-201ENSMUST00000099007 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 2210418O10Rik-201ENSMUST00000099009 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Kera-201ENSMUST00000105286 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Olfr231-202ENSMUST00000214446 5204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 AC112274.1-201ENSMUST00000218957 4274 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Nr3c2-202ENSMUST00000109911 3804 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Olfr1290-204ENSMUST00000217611 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 A230072E10Rik-202ENSMUST00000175825 3292 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Mir292-201ENSMUST00000104847 82 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Gm13195-201ENSMUST00000117229 261 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Gm15297-201ENSMUST00000117795 290 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Gm11409-201ENSMUST00000118621 403 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Gm13484-201ENSMUST00000120738 412 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Gm13867-201ENSMUST00000120844 395 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Gm25103-201ENSMUST00000122671 318 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Gm24188-201ENSMUST00000157980 108 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Gm6647-201ENSMUST00000170514 641 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Mir3090-201ENSMUST00000175597 87 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Gm27202-201ENSMUST00000183838 512 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 AC160635.2-201ENSMUST00000216368 734 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 AC125399.1-201ENSMUST00000224236 595 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 AC124549.1-201ENSMUST00000225912 333 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Olfr1026-201ENSMUST00000056718 965 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Olfr866-201ENSMUST00000062248 1077 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Ang5-201ENSMUST00000066719 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Mir134-201ENSMUST00000083492 71 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Olfr1135-201ENSMUST00000099853 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Gm38243-201ENSMUST00000194737 1567 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Ceacam2-201ENSMUST00000044547 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Slco1a1-201ENSMUST00000042119 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Rbm41-203ENSMUST00000113007 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Slamf7-203ENSMUST00000192195 3975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Nptn-205ENSMUST00000176250 4531 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Fgf7-201ENSMUST00000064794 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 2610044O15Rik8-205ENSMUST00000190157 1776 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Gm21244-202ENSMUST00000189201 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Olfr1444-202ENSMUST00000213606 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Trav6n-6-201ENSMUST00000103613 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Gm24578-201ENSMUST00000103970 129 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Gm13311-201ENSMUST00000117863 379 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Gm15766-201ENSMUST00000118025 813 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Gm11313-201ENSMUST00000118779 432 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Ccdc34os-201ENSMUST00000123633 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Gm568-201ENSMUST00000135777 506 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Gm28129-201ENSMUST00000186273 537 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 4930540E01Rik-201ENSMUST00000192569 1146 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Gm37243-201ENSMUST00000193407 595 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Gm36986-201ENSMUST00000195320 353 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Gm26861-206ENSMUST00000222633 1039 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 AC121137.1-201ENSMUST00000225272 602 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3336J3QMQ6 Erich6b-201ENSMUST00000022579 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms