Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

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Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Gm37329-201ENSMUST00000192973 2057 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Gm5381-201ENSMUST00000117975 1250 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Gm11742-201ENSMUST00000119903 233 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Gm13773-201ENSMUST00000156693 583 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Lcor-202ENSMUST00000163929 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Gm20401-201ENSMUST00000173717 212 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Vmn1r-ps64-201ENSMUST00000173746 655 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Mir3097-201ENSMUST00000175356 67 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Gm27854-201ENSMUST00000175578 244 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Obox4-ps11-201ENSMUST00000176150 724 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Mir6911-201ENSMUST00000184241 69 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Trav6-4-202ENSMUST00000184650 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Gm37741-201ENSMUST00000191768 1256 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Gm43015-201ENSMUST00000199087 565 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Gm42666-201ENSMUST00000201954 152 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Tas2r145-ps3-201ENSMUST00000204526 992 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Olfr574-202ENSMUST00000211329 1039 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Gm7435-201ENSMUST00000214039 486 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Olfr915-201ENSMUST00000215191 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 AC153548.2-201ENSMUST00000219770 885 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 AL671874.1-201ENSMUST00000223746 1123 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Olfr459-201ENSMUST00000050412 1109 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Olfr209-201ENSMUST00000055868 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Gm10064-201ENSMUST00000071235 399 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Mup13-201ENSMUST00000072678 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Olfr1351-201ENSMUST00000080730 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Olfr878-201ENSMUST00000086061 1065 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Smgc-201ENSMUST00000088555 2977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Ssmem1-201ENSMUST00000031797 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Sdr16c6-201ENSMUST00000095151 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Zfyve9-203ENSMUST00000106658 5987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Olfr479-203ENSMUST00000214599 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Tbl1xr1-202ENSMUST00000192328 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Mtm1-213ENSMUST00000171933 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Olfr124-202ENSMUST00000215168 4497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Gm19136-201ENSMUST00000190706 2067 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Gm44535-201ENSMUST00000208889 3136 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Olfr560-201ENSMUST00000210453 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Herc2-201ENSMUST00000076226 15250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Rev3l-207ENSMUST00000164763 10399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Iigp1-202ENSMUST00000066912 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Gm4759-201ENSMUST00000183414 6622 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Gm25422-201ENSMUST00000104219 129 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Olfr359-ps1-201ENSMUST00000115977 926 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Mup-ps19-201ENSMUST00000120390 519 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Gm12936-201ENSMUST00000121439 301 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Gm12413-201ENSMUST00000121508 312 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Gm25290-201ENSMUST00000122796 144 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 1700016G14Rik-201ENSMUST00000136906 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Crem-224ENSMUST00000147138 436 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Gm25430-201ENSMUST00000157614 289 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Gm9027-201ENSMUST00000165914 661 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Obox3-ps5-201ENSMUST00000176412 1003 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Klrb1-ps1-201ENSMUST00000184388 701 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Gm8861-201ENSMUST00000196346 832 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Gm43295-201ENSMUST00000201439 412 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Gm44431-201ENSMUST00000203500 413 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Gm8719-201ENSMUST00000203602 534 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Gm6261-201ENSMUST00000204707 760 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Gm31897-201ENSMUST00000205924 340 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Gm18599-201ENSMUST00000206729 1125 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 9530014B07Rik-201ENSMUST00000221882 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Anapc13-201ENSMUST00000038673 411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Olfr1467-201ENSMUST00000054687 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Olfr509-201ENSMUST00000061690 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Ctsj-201ENSMUST00000071526 1271 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Vmn1r46-201ENSMUST00000075797 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Gm25818-201ENSMUST00000083282 164 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Gm22155-201ENSMUST00000083836 162 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 n-R5s46-201ENSMUST00000083960 116 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Olfr1110-201ENSMUST00000099861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm340F6RGI3 Rprd2-202ENSMUST00000197449 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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