Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Olfr131-202ENSMUST00000172933 1358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Crisp1-201ENSMUST00000026498 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Ube2u-202ENSMUST00000133493 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm43886-201ENSMUST00000205039 2386 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Prl2b1-202ENSMUST00000102954 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm9733-201ENSMUST00000108361 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm7916-201ENSMUST00000120325 456 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm6031-201ENSMUST00000121314 1054 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm8183-201ENSMUST00000183134 980 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Rpl23a-ps9-201ENSMUST00000188369 463 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Rpl23a-ps11-201ENSMUST00000191583 463 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm38093-201ENSMUST00000195210 710 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Igkv13-56-1-201ENSMUST00000198481 209 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 4930598N05Rik-204ENSMUST00000207733 675 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm18672-201ENSMUST00000208035 270 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 AC134334.1-201ENSMUST00000214277 255 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Olfr923-204ENSMUST00000219798 1068 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Olfr177-201ENSMUST00000072853 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 n-R5s95-201ENSMUST00000082684 118 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Tor1aip1-210ENSMUST00000169241 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 A530076I17Rik-202ENSMUST00000228352 1524 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm14415-201ENSMUST00000118260 1578 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 4930532I03Rik-201ENSMUST00000218463 1724 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Defb30-201ENSMUST00000100490 307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm14772-201ENSMUST00000116562 514 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm11898-201ENSMUST00000117161 385 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm12067-201ENSMUST00000119755 1148 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Fyttd1-202ENSMUST00000120345 648 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm14766-201ENSMUST00000121689 367 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Mir5106-201ENSMUST00000174936 73 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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