Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 AC107645.1-201ENSMUST00000228660 1810 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Ttc33-202ENSMUST00000081640 1583 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 P2ry12-202ENSMUST00000170388 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Olfr684-203ENSMUST00000215744 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Akr1c14-202ENSMUST00000118717 3183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm28673-201ENSMUST00000186562 1498 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm37344-203ENSMUST00000195490 1498 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm37180-201ENSMUST00000195335 2819 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Cav1-203ENSMUST00000115454 613 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm13503-201ENSMUST00000119017 446 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm13132-201ENSMUST00000121194 472 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm14500-201ENSMUST00000121647 113 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Mir7222-201ENSMUST00000183740 75 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm4557-201ENSMUST00000185826 907 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm4526-201ENSMUST00000186039 920 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm8708-201ENSMUST00000188500 906 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Olfr864-ps1-201ENSMUST00000212664 930 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 AC158511.1-201ENSMUST00000223622 764 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 AC154335.2-201ENSMUST00000225916 638 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 AC098742.1-201ENSMUST00000227945 373 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Olfr429-201ENSMUST00000060693 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm23875-201ENSMUST00000083711 318 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm10727-201ENSMUST00000197107 1602 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 AC120347.1-201ENSMUST00000223326 1639 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Cyp3a57-201ENSMUST00000079268 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm37181-201ENSMUST00000192513 1727 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Ddx3y-201ENSMUST00000091190 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Psmc6-201ENSMUST00000022380 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 AC124569.3-201ENSMUST00000224860 1621 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Olfr1427-202ENSMUST00000215374 3342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm15058-201ENSMUST00000117689 458 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Defa-ps15-201ENSMUST00000118178 477 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm16106-201ENSMUST00000119187 294 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm13506-201ENSMUST00000120391 1083 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Olfr336-ps1-201ENSMUST00000120897 940 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm14288-202ENSMUST00000123863 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm24507-201ENSMUST00000157683 134 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm22211-201ENSMUST00000158097 156 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm6647-201ENSMUST00000170514 641 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Dlx6os1-204ENSMUST00000184182 146 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm18382-201ENSMUST00000194394 582 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm43100-201ENSMUST00000202985 674 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm4574-201ENSMUST00000207804 542 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 AC160635.2-201ENSMUST00000216368 734 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm40653-202ENSMUST00000222122 1155 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm6988-201ENSMUST00000222676 375 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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Col5a3Q9JLI2 CT009600.2-201ENSMUST00000226638 481 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Ssxb3-202ENSMUST00000089379 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Olfr965-203ENSMUST00000215164 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Olfr845-202ENSMUST00000213344 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 AC121844.3-201ENSMUST00000219124 1785 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm37226-201ENSMUST00000191644 3255 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm42876-201ENSMUST00000196989 3215 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm3182-201ENSMUST00000167902 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Olfr744-203ENSMUST00000216690 1765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Abi1-205ENSMUST00000123948 3067 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm24048-201ENSMUST00000102411 106 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Rps19-ps7-201ENSMUST00000116122 438 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm23178-201ENSMUST00000116782 95 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm14304-201ENSMUST00000117272 446 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm15779-201ENSMUST00000117470 412 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm14706-201ENSMUST00000117744 255 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm12884-201ENSMUST00000120371 325 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm13808-201ENSMUST00000121353 184 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm24730-201ENSMUST00000158228 117 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm27896-201ENSMUST00000175162 317 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm20701-201ENSMUST00000176082 347 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm26992-201ENSMUST00000182089 468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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