Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP97

Senp3, Sentrin-specific protease 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp3Q9EP97 Rbm12-201ENSMUST00000059647 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Kbtbd4-202ENSMUST00000111464 2343 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Vps8-206ENSMUST00000118923 4838 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Tdrd3-205ENSMUST00000170865 2530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Gm38169-201ENSMUST00000191822 2539 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Cyp2d37-ps-201ENSMUST00000100380 590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Gm26209-201ENSMUST00000103852 110 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Rpl36-ps1-201ENSMUST00000119508 303 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Gm13677-201ENSMUST00000120739 595 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 n-R5s76-201ENSMUST00000122700 113 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 A630050E04Rik-201ENSMUST00000151443 581 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Gm25889-201ENSMUST00000157775 107 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Gm24537-201ENSMUST00000157950 102 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Gm16494-201ENSMUST00000165525 261 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Cst12-202ENSMUST00000168443 546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Gm22775-201ENSMUST00000177630 120 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Gm23569-201ENSMUST00000180120 120 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 AC160123.1-201ENSMUST00000213443 570 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Dnah12-202ENSMUST00000073309 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Gm24152-201ENSMUST00000082764 163 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Snord14e-201ENSMUST00000082857 90 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Eya3-202ENSMUST00000079157 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Olfr718-ps1-201ENSMUST00000164536 3962 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Zfp541-203ENSMUST00000210805 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Ptchd1-201ENSMUST00000038665 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Cdh26-201ENSMUST00000042092 2891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Trip12-207ENSMUST00000186648 6442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Stil-201ENSMUST00000030490 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Gm14399-204ENSMUST00000109060 1911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Clasp1-221ENSMUST00000191823 3916 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Slc22a26-201ENSMUST00000065634 2007 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Kif1a-204ENSMUST00000171796 8206 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Erc2-205ENSMUST00000210135 6233 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Rad51ap1-201ENSMUST00000112220 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Cnpy1-203ENSMUST00000120068 2284 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Slc6a16-203ENSMUST00000213347 2865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Zfp952-201ENSMUST00000087666 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 4933414I15Rik-201ENSMUST00000109123 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Gm14591-201ENSMUST00000120407 518 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Gm5135-201ENSMUST00000121100 573 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Gm14581-201ENSMUST00000121726 198 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Gm15834-201ENSMUST00000129740 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Gm15879-201ENSMUST00000139334 809 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Sox6-203ENSMUST00000166207 2825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Gm29574-201ENSMUST00000186226 696 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Gm37387-201ENSMUST00000192201 1806 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Btbd16-204ENSMUST00000208593 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Olfr847-202ENSMUST00000216839 2385 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 AC122539.2-201ENSMUST00000220207 404 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 B020018J22Rik-201ENSMUST00000223085 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 AC122402.1-201ENSMUST00000225199 2303 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 AC118250.2-201ENSMUST00000228890 416 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Ovol1-201ENSMUST00000025861 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Pkia-201ENSMUST00000028999 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Mpp1-201ENSMUST00000033775 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Bbs9-201ENSMUST00000039798 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Plekha2-201ENSMUST00000064883 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Zfp605-201ENSMUST00000086686 2085 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Clec3a-201ENSMUST00000009018 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Defb23-201ENSMUST00000099206 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Myom1-203ENSMUST00000179759 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Nrxn3-201ENSMUST00000057634 4634 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Ednrb-202ENSMUST00000172237 3989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Gm16316-201ENSMUST00000154065 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Snrnp200-201ENSMUST00000103220 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Ripor2-203ENSMUST00000091694 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 AC138716.1-201ENSMUST00000226350 2959 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Dync2h1-202ENSMUST00000139115 2892 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Cks1brt-201ENSMUST00000076896 2301 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Gm37363-201ENSMUST00000192336 2233 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 9330162B11Rik-201ENSMUST00000195397 2212 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Gm5315-201ENSMUST00000204430 1897 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Gpkow-201ENSMUST00000049896 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Fut10-203ENSMUST00000161502 3527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Snx32-201ENSMUST00000070172 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Gm43910-201ENSMUST00000204561 3241 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 9530086O07Rik-201ENSMUST00000203503 2685 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Fam198b-201ENSMUST00000029567 6627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Teddm1a-201ENSMUST00000050660 1317 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Gm26135-201ENSMUST00000101993 72 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Gm15694-201ENSMUST00000121984 283 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Gm11967-201ENSMUST00000135132 480 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Gm7162-201ENSMUST00000161205 1024 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Gm4675-201ENSMUST00000163396 502 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Gm7335-201ENSMUST00000172475 373 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Gm6919-201ENSMUST00000180049 483 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Senp3Q9EP97 Gm7468-201ENSMUST00000203900 652 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms