Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Olfr1449-203ENSMUST00000214079 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm33378-201ENSMUST00000219831 2758 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Il6-203ENSMUST00000199183 2343 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm37529-201ENSMUST00000195618 4321 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Olfr911-ps1-202ENSMUST00000216496 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm3055-201ENSMUST00000105316 720 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm13023-202ENSMUST00000105770 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm15022-201ENSMUST00000122074 746 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm11714-201ENSMUST00000136927 876 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm25907-201ENSMUST00000158486 125 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm4831-201ENSMUST00000174626 594 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm37421-201ENSMUST00000193088 132 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 AL807824.1-201ENSMUST00000223151 183 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm2645-201ENSMUST00000223516 547 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 AC161884.2-201ENSMUST00000224513 227 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Zfp781-201ENSMUST00000076281 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Snord59a-201ENSMUST00000082844 74 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gramd1c-201ENSMUST00000036174 3501 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm35629-201ENSMUST00000209684 2241 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Iqch-203ENSMUST00000163624 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Macc1-202ENSMUST00000221866 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Usf3-204ENSMUST00000169582 12604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Olfr684-203ENSMUST00000215744 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Olfr1307-201ENSMUST00000099604 15582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm37509-201ENSMUST00000194867 3169 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 AC153494.1-201ENSMUST00000218664 3041 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 AC170999.1-201ENSMUST00000226359 1585 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Zfp780b-204ENSMUST00000206685 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Olfr1209-202ENSMUST00000213136 5611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Dmxl2-202ENSMUST00000118600 9465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Olfr1034-201ENSMUST00000213496 4882 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm44250-201ENSMUST00000203092 4229 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps120-201ENSMUST00000176341 2409 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm14086-201ENSMUST00000117152 173 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm13172-201ENSMUST00000118685 256 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm9435-201ENSMUST00000120379 877 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm12650-201ENSMUST00000121966 258 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm3727-201ENSMUST00000168458 995 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Rps27-201ENSMUST00000170122 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm24949-201ENSMUST00000183609 215 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm6137-201ENSMUST00000187552 578 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm28468-201ENSMUST00000188536 615 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 4930434O05Rik-201ENSMUST00000203259 387 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm18215-201ENSMUST00000204429 798 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm8319-201ENSMUST00000205708 641 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Spata19-202ENSMUST00000214158 627 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Olfr1092-ps1-201ENSMUST00000216544 398 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm2099-201ENSMUST00000220979 412 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 AC154583.1-201ENSMUST00000224788 655 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm23459-201ENSMUST00000083259 131 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm43011-201ENSMUST00000197897 4433 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm43317-201ENSMUST00000197924 2544 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm37606-201ENSMUST00000191816 3116 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm5715-201ENSMUST00000196854 1465 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Nr1h5-201ENSMUST00000058899 2835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Cdh10-202ENSMUST00000166873 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Olfr1085-203ENSMUST00000214566 5129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Zfp932-202ENSMUST00000112536 2509 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Igkv1-132-201ENSMUST00000103305 362 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Traj7-201ENSMUST00000103733 59 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm22273-201ENSMUST00000104040 132 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm11486-201ENSMUST00000107322 478 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm16394-201ENSMUST00000117289 675 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm15531-201ENSMUST00000118062 252 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm15034-201ENSMUST00000120043 349 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm13488-201ENSMUST00000120419 179 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm15388-201ENSMUST00000121578 726 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm23965-201ENSMUST00000157969 142 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm17023-201ENSMUST00000165885 448 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm6632-201ENSMUST00000168425 954 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm26993-201ENSMUST00000182766 789 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm5058-201ENSMUST00000187331 463 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm28103-201ENSMUST00000188392 416 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 1700111N16Rik-201ENSMUST00000188663 1133 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm21803-201ENSMUST00000188897 693 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm28137-201ENSMUST00000191478 416 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm34176-201ENSMUST00000192621 474 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Ighv1-27-201ENSMUST00000194473 340 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms