Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp27Q8CEG8 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp27Q8CEG8 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp27Q8CEG8 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp27Q8CEG8 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp27Q8CEG8 Chaer1-201ENSMUST00000201649 651 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp27Q8CEG8 AC161456.1-201ENSMUST00000206771 887 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp27Q8CEG8 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
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Usp27Q8CEG8 CT025548.1-201ENSMUST00000227459 257 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp27Q8CEG8 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp27Q8CEG8 Tas2r129-201ENSMUST00000070991 965 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp27Q8CEG8 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp27Q8CEG8 Slc5a12-201ENSMUST00000045972 3529 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp27Q8CEG8 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp27Q8CEG8 Mybpc1-201ENSMUST00000119185 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp27Q8CEG8 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
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Usp27Q8CEG8 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp27Q8CEG8 F630028O10Rik-201ENSMUST00000133125 2771 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp27Q8CEG8 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp27Q8CEG8 Gm8989-201ENSMUST00000184782 7275 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Usp27Q8CEG8 Pi15-201ENSMUST00000088476 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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Usp27Q8CEG8 Olfr843-203ENSMUST00000214267 7071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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Usp27Q8CEG8 Gm15592-201ENSMUST00000143135 1707 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp27Q8CEG8 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp27Q8CEG8 Gm44250-201ENSMUST00000203092 4229 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp27Q8CEG8 Skint5-204ENSMUST00000171627 1611 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp27Q8CEG8 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp27Q8CEG8 Cypt1-202ENSMUST00000115422 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp27Q8CEG8 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp27Q8CEG8 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp27Q8CEG8 Gm11636-201ENSMUST00000152172 774 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp27Q8CEG8 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp27Q8CEG8 Gm17223-201ENSMUST00000171413 481 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp27Q8CEG8 Gm22411-201ENSMUST00000175462 126 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp27Q8CEG8 Gm22002-201ENSMUST00000175622 125 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp27Q8CEG8 Gm8321-201ENSMUST00000181691 980 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp27Q8CEG8 4930447N08Rik-201ENSMUST00000196290 497 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp27Q8CEG8 Pvrig-ps-201ENSMUST00000199472 204 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp27Q8CEG8 Gm17984-201ENSMUST00000205286 859 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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Usp27Q8CEG8 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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Usp27Q8CEG8 Ccl8-201ENSMUST00000009329 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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Usp27Q8CEG8 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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Usp27Q8CEG8 BC030870-201ENSMUST00000098713 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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Usp27Q8CEG8 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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Usp27Q8CEG8 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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Usp27Q8CEG8 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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Usp27Q8CEG8 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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Usp27Q8CEG8 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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Usp27Q8CEG8 Gm44485-201ENSMUST00000199569 137 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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Usp27Q8CEG8 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp27Q8CEG8 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp27Q8CEG8 AC121978.1-201ENSMUST00000228357 380 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp27Q8CEG8 Olfr664-201ENSMUST00000072887 966 ntAPPRIS P5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp27Q8CEG8 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp27Q8CEG8 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp27Q8CEG8 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp27Q8CEG8 Kncn-201ENSMUST00000097918 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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