Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm5045-201ENSMUST00000027054 810 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
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Atg4aQ8C9S8 Gm24919-201ENSMUST00000083020 106 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg4aQ8C9S8 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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Atg4aQ8C9S8 4930444F02Rik-201ENSMUST00000215429 6871 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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Atg4aQ8C9S8 Homer1-205ENSMUST00000109492 1533 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Atg4aQ8C9S8 E330013P04Rik-201ENSMUST00000065383 2070 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Atg4aQ8C9S8 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Atg4aQ8C9S8 Gm16321-201ENSMUST00000155184 574 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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Atg4aQ8C9S8 Gm18828-202ENSMUST00000181035 310 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg4aQ8C9S8 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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Atg4aQ8C9S8 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg4aQ8C9S8 Gm10292-202ENSMUST00000193165 585 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg4aQ8C9S8 Gm37243-201ENSMUST00000193407 595 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg4aQ8C9S8 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg4aQ8C9S8 Gm42952-201ENSMUST00000196393 731 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg4aQ8C9S8 1700065J11Rik-201ENSMUST00000201560 424 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg4aQ8C9S8 Gm44171-201ENSMUST00000203701 2109 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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