Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm37661-201ENSMUST00000191863 1550 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm44675-201ENSMUST00000208188 2927 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Fam205c-201ENSMUST00000055944 1655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm6757-201ENSMUST00000189810 1706 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm38264-201ENSMUST00000194850 2032 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Olfr690-202ENSMUST00000211006 2048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm24272-201ENSMUST00000102329 98 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Igkc-201ENSMUST00000103410 532 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Mup1-203ENSMUST00000107499 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm11833-201ENSMUST00000118393 853 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm6664-201ENSMUST00000119138 468 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm8757-201ENSMUST00000119660 372 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm13711-201ENSMUST00000119708 453 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Snord116l12-201ENSMUST00000179816 94 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm20619-204ENSMUST00000181343 786 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm27342-201ENSMUST00000183530 109 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 1700040K01Rik-201ENSMUST00000195145 438 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 4930518I17Rik-201ENSMUST00000203902 656 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 4930598N05Rik-201ENSMUST00000207048 550 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm18113-201ENSMUST00000220630 303 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 AC120540.1-201ENSMUST00000221879 324 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm40662-201ENSMUST00000222208 453 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm40662-202ENSMUST00000222263 487 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 CT025552.2-201ENSMUST00000225497 317 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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Dsg1bQ7TSF1 Esp34-201ENSMUST00000173055 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Tor1aip1-210ENSMUST00000169241 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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Dsg1bQ7TSF1 Dnm3os-201ENSMUST00000139662 7928 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
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Dsg1bQ7TSF1 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Igkv4-70-201ENSMUST00000103348 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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Dsg1bQ7TSF1 Mir1900-201ENSMUST00000122714 78 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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Dsg1bQ7TSF1 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Mir1960-201ENSMUST00000157488 78 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm17030-201ENSMUST00000167016 393 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm24561-201ENSMUST00000175182 95 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm25525-201ENSMUST00000177701 107 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm26178-201ENSMUST00000177706 107 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm26465-201ENSMUST00000178517 107 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm24317-201ENSMUST00000178536 107 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm25021-201ENSMUST00000179184 107 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm22995-201ENSMUST00000179670 107 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm24424-201ENSMUST00000179714 107 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm24389-201ENSMUST00000179962 107 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm25672-201ENSMUST00000180111 107 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm29163-201ENSMUST00000188029 107 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm37065-201ENSMUST00000191636 444 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Traj59-202ENSMUST00000197589 62 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm42604-201ENSMUST00000200077 801 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm30498-201ENSMUST00000204033 615 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 4833404L02Rik-201ENSMUST00000206290 908 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm45044-201ENSMUST00000208078 396 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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