Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Gm16430-202ENSMUST00000178145 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Gm21909-201ENSMUST00000178260 439 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Gm16405-202ENSMUST00000180150 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Gm28652-201ENSMUST00000187008 599 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Igkv15-101-201ENSMUST00000195917 299 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Selenok-ps6-201ENSMUST00000221812 283 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 AC131100.2-201ENSMUST00000227701 998 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Olfr1302-201ENSMUST00000054004 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Olfr1097-202ENSMUST00000217403 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Gm10441-201ENSMUST00000200950 1546 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Clec5a-202ENSMUST00000101491 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Btbd35f2-201ENSMUST00000179991 1949 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Btbd35f16-201ENSMUST00000185755 1949 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Gm26814-201ENSMUST00000181178 4149 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Amd1-201ENSMUST00000099945 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Catsperg1-212ENSMUST00000169143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Zfp369-202ENSMUST00000126879 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Tlr13-201ENSMUST00000040065 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 2010013B24Rik-201ENSMUST00000126922 747 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Gm22277-201ENSMUST00000157204 277 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Rps27-201ENSMUST00000170122 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Vmn1r57-201ENSMUST00000170780 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Olfr762-ps1-201ENSMUST00000172948 927 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Gm21882-201ENSMUST00000178332 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Gm9320-201ENSMUST00000184151 473 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Gm20203-201ENSMUST00000192352 332 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Igkv12-47-201ENSMUST00000196961 356 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Gm42663-201ENSMUST00000199883 351 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Gm44214-201ENSMUST00000204153 606 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 AC102291.1-201ENSMUST00000227164 529 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Prl2a1-201ENSMUST00000023602 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Smr3a-201ENSMUST00000031211 635 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Ube2d4-201ENSMUST00000075109 406 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Tfpi-201ENSMUST00000028487 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Gm37964-201ENSMUST00000192459 4905 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Gm37776-201ENSMUST00000193471 2497 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Olfr129-202ENSMUST00000216476 5275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Gm31258-201ENSMUST00000194532 3297 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Clec9a-201ENSMUST00000058352 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Serpinb9f-201ENSMUST00000075515 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Olfr552-202ENSMUST00000215712 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Gabrg2-201ENSMUST00000070725 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Mmp8-201ENSMUST00000018765 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Gm23948-201ENSMUST00000104030 132 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Gm13023-202ENSMUST00000105770 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Gm11825-201ENSMUST00000120710 736 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Gm12222-201ENSMUST00000121368 260 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Gm13077-201ENSMUST00000121941 484 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Gm7609-204ENSMUST00000161424 461 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Obox4-ps11-201ENSMUST00000176150 724 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Gm26962-201ENSMUST00000182545 265 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Gm4832-202ENSMUST00000183295 375 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Mrgprc1-ps-201ENSMUST00000185552 952 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Gm2142-201ENSMUST00000197899 589 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 4930443G03Rik-201ENSMUST00000203475 1282 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Gm18791-201ENSMUST00000204611 726 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Gm44993-201ENSMUST00000208435 842 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 4930448C13Rik-204ENSMUST00000221610 1044 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Olfr178-201ENSMUST00000058564 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Amelx-201ENSMUST00000066112 802 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ctnna3Q65CL1 Smim4-203ENSMUST00000090205 426 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.3 ms