Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Vmn1r185-205ENSMUST00000227461 5318 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rbbp4Q60972 Ulbp1-203ENSMUST00000218087 5959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rbbp4Q60972 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rbbp4Q60972 Gm33378-201ENSMUST00000219831 2758 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rbbp4Q60972 Gm11674-201ENSMUST00000124855 3005 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rbbp4Q60972 Gm37010-201ENSMUST00000194539 1704 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rbbp4Q60972 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rbbp4Q60972 Fam122b-202ENSMUST00000114838 3536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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Rbbp4Q60972 Gprc6a-202ENSMUST00000218684 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rbbp4Q60972 4932411K12Rik-201ENSMUST00000190493 3156 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rbbp4Q60972 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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Rbbp4Q60972 AC168274.1-201ENSMUST00000218657 1864 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rbbp4Q60972 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rbbp4Q60972 Igkv6-17-201ENSMUST00000103391 377 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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Rbbp4Q60972 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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Rbbp4Q60972 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rbbp4Q60972 1700061H18Rik-202ENSMUST00000147221 564 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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Rbbp4Q60972 5330429C05Rik-201ENSMUST00000154615 487 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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Rbbp4Q60972 1700031M16Rik-204ENSMUST00000189724 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rbbp4Q60972 1700031M16Rik-207ENSMUST00000191513 847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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Rbbp4Q60972 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rbbp4Q60972 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rbbp4Q60972 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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Rbbp4Q60972 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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Rbbp4Q60972 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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Rbbp4Q60972 Myo3a-201ENSMUST00000044749 5082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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Rbbp4Q60972 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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Rbbp4Q60972 4430402I18Rik-203ENSMUST00000160542 1057 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Rbbp4Q60972 Gm17669-201ENSMUST00000163749 465 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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Rbbp4Q60972 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Rbbp4Q60972 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Rbbp4Q60972 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Rbbp4Q60972 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rbbp4Q60972 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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