Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6673-201ENSMUST00000166114 700 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20545-201ENSMUST00000174739 210 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm32950-201ENSMUST00000193336 232 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Mirlet7e-201ENSMUST00000196737 93 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7721-201ENSMUST00000200446 546 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42458-201ENSMUST00000201914 369 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44991-201ENSMUST00000208669 479 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 AC122395.1-201ENSMUST00000214666 374 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4263-201ENSMUST00000220693 1101 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 CT030242.3-201ENSMUST00000221231 581 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 AC154305.3-201ENSMUST00000224661 552 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Rps4x-201ENSMUST00000033683 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr640-201ENSMUST00000084799 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1407-ps1-201ENSMUST00000085885 797 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Smgc-201ENSMUST00000088555 2977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19301-201ENSMUST00000174283 2210 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Rprd2-202ENSMUST00000197449 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Vmn2r89-201ENSMUST00000159611 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Trim23-202ENSMUST00000069174 4258 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Rif1-201ENSMUST00000112693 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1191-ps1-201ENSMUST00000120598 4677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Vmn2r112-201ENSMUST00000097381 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Postn-202ENSMUST00000081564 2670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 F630028O10Rik-201ENSMUST00000133125 2771 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr18-203ENSMUST00000212943 2896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Axdnd1-211ENSMUST00000213088 3561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Xkr9-201ENSMUST00000088542 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 D030025E07Rik-203ENSMUST00000197413 2346 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Prune2-201ENSMUST00000087689 12512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Muc15-203ENSMUST00000111017 3095 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1451-202ENSMUST00000207997 1698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp120-203ENSMUST00000109931 4033 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc29-203ENSMUST00000117845 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15772-201ENSMUST00000118533 438 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm25293-201ENSMUST00000122792 285 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 4930513N10Rik-202ENSMUST00000132616 490 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm25906-201ENSMUST00000158489 126 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16566-201ENSMUST00000160387 910 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10269-201ENSMUST00000165229 372 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Vmn1r-ps77-201ENSMUST00000174184 921 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl9-ps5-201ENSMUST00000174221 571 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Vmn1r-ps75-201ENSMUST00000174316 920 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16456-201ENSMUST00000174431 920 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Mir3473g-201ENSMUST00000183494 136 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Mir7012-201ENSMUST00000183900 64 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Mrgprb9-ps-201ENSMUST00000188739 892 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 1700031M16Rik-204ENSMUST00000189724 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Mrgpra14-201ENSMUST00000189782 913 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 1700031M16Rik-207ENSMUST00000191513 847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42579-201ENSMUST00000200512 734 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm32453-201ENSMUST00000204183 456 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 AC153800.1-201ENSMUST00000219212 365 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 AC124687.2-201ENSMUST00000221927 1228 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 1700037F03Rik-201ENSMUST00000223032 365 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 AC241593.2-201ENSMUST00000225099 510 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr682-ps1-201ENSMUST00000071242 934 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm23302-201ENSMUST00000082710 100 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 n-R5s205-201ENSMUST00000083149 125 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp329-201ENSMUST00000072222 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Adam25-201ENSMUST00000096663 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 4932411K12Rik-201ENSMUST00000190493 3156 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Slfn8-203ENSMUST00000108152 3083 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr919-203ENSMUST00000217508 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Rapgef4-201ENSMUST00000028525 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Abca16-202ENSMUST00000120490 5088 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp780b-204ENSMUST00000206685 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
E130208F15RikQ3UPV3 Vmn1r84-205ENSMUST00000228653 2769 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms