Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Nucb2-203ENSMUST00000183175 1913 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 4932414J04Rik-201ENSMUST00000152483 3059 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Serpina10-201ENSMUST00000044231 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm22671-201ENSMUST00000104420 134 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm11970-201ENSMUST00000116105 320 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm12075-201ENSMUST00000117426 397 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm14292-201ENSMUST00000118761 456 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm12034-201ENSMUST00000119032 399 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm14631-201ENSMUST00000119067 594 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm12967-201ENSMUST00000122147 289 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm24385-201ENSMUST00000122694 350 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Traj54-201ENSMUST00000165071 54 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Ccdc152-201ENSMUST00000165386 798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm26977-201ENSMUST00000183151 996 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Scgb2b30-201ENSMUST00000187013 336 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm20268-201ENSMUST00000187932 845 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm29462-201ENSMUST00000191458 288 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Ighv3-7-201ENSMUST00000193370 348 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm33206-201ENSMUST00000193544 454 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm43243-201ENSMUST00000199964 278 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm44125-201ENSMUST00000203068 448 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm45081-201ENSMUST00000206281 572 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Abca15-204ENSMUST00000207220 567 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm44611-201ENSMUST00000207507 355 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm45049-201ENSMUST00000207586 591 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm45722-201ENSMUST00000213075 466 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 AC154296.2-201ENSMUST00000214696 545 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 AC207128.1-201ENSMUST00000225928 799 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 AC154640.3-201ENSMUST00000227492 846 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 AC163646.2-201ENSMUST00000227962 141 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm23733-201ENSMUST00000083750 106 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm10717-202ENSMUST00000099042 669 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 AC124586.1-201ENSMUST00000221673 2795 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Glra4-201ENSMUST00000018739 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Ccdc7b-201ENSMUST00000026912 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Zfp758-202ENSMUST00000088765 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Vmn1r35-202ENSMUST00000227346 1854 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm42728-201ENSMUST00000202644 1552 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Olfr684-204ENSMUST00000217136 3182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Olfr672-202ENSMUST00000213942 1490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm38307-201ENSMUST00000195630 1840 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm23358-201ENSMUST00000103887 110 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm13929-201ENSMUST00000117553 1125 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm12604-201ENSMUST00000118382 380 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm12727-201ENSMUST00000119885 359 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm12515-201ENSMUST00000120116 361 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm13368-201ENSMUST00000122443 430 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.3 ms