Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Traf3ip1Q149C2 Tsga10-203ENSMUST00000114902 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Traf3ip1Q149C2 Gm14643-201ENSMUST00000144412 1848 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Traf3ip1Q149C2 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Traf3ip1Q149C2 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Traf3ip1Q149C2 Serpini1-201ENSMUST00000029423 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Traf3ip1Q149C2 Map3k19-201ENSMUST00000061512 3936 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Traf3ip1Q149C2 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Gm37726-201ENSMUST00000193246 3886 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Cyp2c38-201ENSMUST00000035488 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Atp7a-201ENSMUST00000055941 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Slfn14-201ENSMUST00000163961 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Olfr671-202ENSMUST00000210963 3157 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Akap4-202ENSMUST00000115750 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Fam107b-205ENSMUST00000115055 515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Gm22343-201ENSMUST00000122648 286 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Gm24371-201ENSMUST00000122662 267 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Gm16260-201ENSMUST00000155141 304 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Gm9569-201ENSMUST00000187492 787 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Gm18426-201ENSMUST00000191874 973 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Gm20056-201ENSMUST00000194813 519 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Gm43968-201ENSMUST00000203388 389 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 B130024G19Rik-205ENSMUST00000207952 485 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Gm18127-201ENSMUST00000208479 725 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Gm21244-202ENSMUST00000189201 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Zfp329-202ENSMUST00000108546 2577 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 AC139218.1-201ENSMUST00000228215 4287 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Olfr13-202ENSMUST00000216179 3677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r185-209ENSMUST00000228133 5749 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Gm29098-201ENSMUST00000186104 1498 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Gm28130-201ENSMUST00000186321 1498 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Gm28089-202ENSMUST00000187266 1498 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Gm29204-202ENSMUST00000187384 1498 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Gm28753-201ENSMUST00000187804 1498 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Gm28518-203ENSMUST00000188788 1498 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Gm29131-202ENSMUST00000189485 1498 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Gm28284-202ENSMUST00000190221 1498 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Gm28764-203ENSMUST00000191194 1498 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Glb1l3-201ENSMUST00000034448 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Gm19113-201ENSMUST00000217552 1828 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Arhgef6-201ENSMUST00000033468 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Clec2g-203ENSMUST00000142388 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r6-205ENSMUST00000227631 7805 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Plcz1-201ENSMUST00000032356 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Gm25179-201ENSMUST00000122632 128 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 4933416I08Rik-201ENSMUST00000125315 703 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Gm25383-201ENSMUST00000157810 144 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Dnaja1-ps-201ENSMUST00000162103 642 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Stk-ps2-204ENSMUST00000187808 616 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Gm20940-201ENSMUST00000197308 360 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Gm43093-201ENSMUST00000202439 1213 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Gm45343-201ENSMUST00000210452 828 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Gm10933-201ENSMUST00000221891 1861 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Gm37010-201ENSMUST00000194539 1704 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 A530064N14Rik-201ENSMUST00000195338 1492 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Olfr745-202ENSMUST00000213127 1930 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 St18-213ENSMUST00000163727 5604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Ank2-207ENSMUST00000182064 12413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Dst-215ENSMUST00000185269 16340 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 AC159326.1-201ENSMUST00000219989 1302 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Olfr1279-203ENSMUST00000216697 3385 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Zgrf1-202ENSMUST00000195955 3804 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Olfr1444-202ENSMUST00000213606 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Zfp329-201ENSMUST00000072222 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Lpp-202ENSMUST00000078988 15440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 AC159193.1-201ENSMUST00000222872 2517 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Defb30-201ENSMUST00000100490 307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Txndc8-201ENSMUST00000102897 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Gm14995-201ENSMUST00000117135 391 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Traf3ip1Q149C2 Gm12245-201ENSMUST00000117266 357 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.8 ms