Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm44250-201ENSMUST00000203092 4229 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 March1-203ENSMUST00000098708 4000 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Olfr198-202ENSMUST00000208244 2200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Rgsl1-201ENSMUST00000124558 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Zfhx4-205ENSMUST00000176383 13500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm13582-201ENSMUST00000146034 2655 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r219-203ENSMUST00000227388 7948 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Mga-201ENSMUST00000046717 11982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm28183-201ENSMUST00000191321 1406 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Smarca2-220ENSMUST00000207054 2333 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm13195-201ENSMUST00000117229 261 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm11481-201ENSMUST00000120069 255 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm14027-201ENSMUST00000135186 622 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm14135-201ENSMUST00000135438 591 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm14637-201ENSMUST00000156516 444 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm22725-201ENSMUST00000158092 110 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Il18-202ENSMUST00000180021 702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Mir7222-201ENSMUST00000183740 75 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm28840-203ENSMUST00000187128 975 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Ighv3-4-201ENSMUST00000193408 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 AL645522.1-201ENSMUST00000197692 104 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 AC122395.1-201ENSMUST00000214666 374 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 AC161269.1-201ENSMUST00000228426 318 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm5045-201ENSMUST00000027054 810 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Il18-201ENSMUST00000059081 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm24706-201ENSMUST00000082806 137 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Olfr1407-ps1-201ENSMUST00000085885 797 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r84-205ENSMUST00000228653 2769 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 AC133076.2-201ENSMUST00000227678 3532 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Olfr1200-202ENSMUST00000217588 4996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Vmn2r-ps56-201ENSMUST00000174814 2596 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm6634-201ENSMUST00000180497 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm3978-201ENSMUST00000163406 2512 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 Gm14912-201ENSMUST00000120166 1773 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 AC115970.1-201ENSMUST00000218910 1758 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 Xist-201ENSMUST00000127786 17769 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 Gm5346-201ENSMUST00000056023 2326 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 Vmn2r89-201ENSMUST00000159611 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 Gm4064-201ENSMUST00000187482 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 Olfr250-202ENSMUST00000216168 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 Adam28-201ENSMUST00000022642 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 Olfr231-202ENSMUST00000214446 5204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 Olfr1420-203ENSMUST00000217281 2998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 Olfr893-202ENSMUST00000211975 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 AC124556.1-201ENSMUST00000218256 1319 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 Usf3-204ENSMUST00000169582 12604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 Traj7-201ENSMUST00000103733 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 Gm8202-201ENSMUST00000117682 310 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 Gm9429-201ENSMUST00000117804 868 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 Gm15390-201ENSMUST00000120323 738 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 Gm14601-201ENSMUST00000120892 236 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 Gm22343-201ENSMUST00000122648 286 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 Gm24216-201ENSMUST00000158259 117 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r-ps141-201ENSMUST00000176293 753 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 Gm37614-201ENSMUST00000195645 210 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 Gm43968-201ENSMUST00000203388 389 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 Gm5581-202ENSMUST00000204992 714 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 AC165245.1-201ENSMUST00000214181 636 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 AC159238.1-201ENSMUST00000220699 343 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 AC138765.1-201ENSMUST00000228657 385 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 A730045E13Rik-201ENSMUST00000066740 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 Gm23459-201ENSMUST00000083259 131 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 Gm9386-201ENSMUST00000095195 381 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 Gm43266-201ENSMUST00000201049 1771 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 Zscan4a-201ENSMUST00000210573 2279 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 Olfr487-202ENSMUST00000216489 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 Pate2-202ENSMUST00000118254 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r185-203ENSMUST00000227264 5589 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 Olfr348-203ENSMUST00000214909 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 Zfp280c-201ENSMUST00000072292 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 Olfr695-201ENSMUST00000216868 3953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 Ttn-202ENSMUST00000099980 16891 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 Pfpl-201ENSMUST00000168148 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 E330016L19Rik-201ENSMUST00000140614 1959 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 Gm10441-201ENSMUST00000200950 1546 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 Gm3604-202ENSMUST00000187656 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 A530064N14Rik-201ENSMUST00000195338 1492 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ttc39dQ0VF76 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms