Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Olfr1069-ps1-201ENSMUST00000120755 965 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm16126-201ENSMUST00000126025 589 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Tbata-207ENSMUST00000140456 953 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm16531-201ENSMUST00000180658 967 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm29540-201ENSMUST00000188207 337 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm29020-201ENSMUST00000191166 290 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm8929-201ENSMUST00000197781 1132 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm44432-201ENSMUST00000203342 938 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm44232-201ENSMUST00000204537 225 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 A730082K24Rik-201ENSMUST00000205365 465 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm4574-201ENSMUST00000207804 542 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm18205-201ENSMUST00000209215 841 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 CT025625.1-201ENSMUST00000217786 460 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 AC154556.1-201ENSMUST00000224587 885 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 AC139294.2-201ENSMUST00000227159 285 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 AC107711.2-203ENSMUST00000227827 762 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Mir143-201ENSMUST00000083511 63 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm43662-201ENSMUST00000198310 2271 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gulp1-206ENSMUST00000162600 2798 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Clec9a-201ENSMUST00000058352 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Olfr1443-203ENSMUST00000215134 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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Sh3bp1P55194 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm2396-202ENSMUST00000188232 3433 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Vmn1r210-202ENSMUST00000226180 3116 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm42927-201ENSMUST00000200624 3841 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gramd1c-201ENSMUST00000036174 3501 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Olfr695-201ENSMUST00000216868 3953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Slamf7-203ENSMUST00000192195 3975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Olfr725-202ENSMUST00000206920 1519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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Sh3bp1P55194 Zc4h2-203ENSMUST00000120620 2156 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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Sh3bp1P55194 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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Sh3bp1P55194 Gm13902-201ENSMUST00000120168 605 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
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Sh3bp1P55194 Tpo-203ENSMUST00000155263 664 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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Sh3bp1P55194 AC121947.1-201ENSMUST00000221755 1145 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
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Sh3bp1P55194 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
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Sh3bp1P55194 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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Sh3bp1P55194 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
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Sh3bp1P55194 Fat2-201ENSMUST00000068853 14528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm37018-201ENSMUST00000192441 3869 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Ckap5-201ENSMUST00000046769 6511 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Olfr395-202ENSMUST00000215690 4275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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Sh3bp1P55194 Scel-201ENSMUST00000095576 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Olfr518-202ENSMUST00000217803 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm44435-201ENSMUST00000204379 4119 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms