Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm6632-201ENSMUST00000168425 954 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm27883-201ENSMUST00000183941 102 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm27805-201ENSMUST00000184513 79 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm37828-201ENSMUST00000192496 432 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Csn2-208ENSMUST00000198057 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm44796-201ENSMUST00000205272 626 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprmP28828 AC154623.1-201ENSMUST00000224348 805 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Apoo-ps-201ENSMUST00000061241 586 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Oprk1-204ENSMUST00000160777 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Fbxl13-202ENSMUST00000115234 2143 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Zfp131-202ENSMUST00000178271 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm29968-201ENSMUST00000222815 1387 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Maoa-201ENSMUST00000026013 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprmP28828 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprmP28828 D7Ertd443e-202ENSMUST00000106129 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Zfp426-201ENSMUST00000080386 2417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprmP28828 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm12609-201ENSMUST00000129908 610 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Mir713-201ENSMUST00000178651 108 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm28654-201ENSMUST00000189801 379 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprmP28828 1700015G11Rik-204ENSMUST00000190307 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm38221-201ENSMUST00000195146 365 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm30043-201ENSMUST00000196689 733 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm2314-201ENSMUST00000200391 586 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm43700-201ENSMUST00000200967 316 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm44038-201ENSMUST00000203952 889 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprmP28828 n-R5s167-201ENSMUST00000083227 121 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Fam24a-201ENSMUST00000084505 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprmP28828 AC103672.2-201ENSMUST00000228146 1687 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gcnt1-201ENSMUST00000169897 4594 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Serpinb3b-202ENSMUST00000166100 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Fam135a-206ENSMUST00000187369 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Asah2-201ENSMUST00000096119 4682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Ktn1-226ENSMUST00000191511 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm21704-201ENSMUST00000169382 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprmP28828 AC154257.1-201ENSMUST00000224811 1525 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprmP28828 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Pagr1a-201ENSMUST00000162069 422 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm18547-201ENSMUST00000192439 811 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm10292-202ENSMUST00000193165 585 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm45434-201ENSMUST00000210550 293 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprmP28828 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Oog1-202ENSMUST00000222112 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm36963-201ENSMUST00000193506 2324 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm12633-201ENSMUST00000117742 1705 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm42615-201ENSMUST00000197704 1820 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Tsga10-203ENSMUST00000114902 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprmP28828 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Akap13-205ENSMUST00000207750 12597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Lair1-203ENSMUST00000086401 2496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprmP28828 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprmP28828 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Olfr1223-201ENSMUST00000217342 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprmP28828 B830042I05Rik-201ENSMUST00000208333 1620 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm14750-201ENSMUST00000118262 516 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Olfr337-ps1-201ENSMUST00000120380 456 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprmP28828 n-R5s61-201ENSMUST00000122711 118 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm2147-201ENSMUST00000193588 639 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprmP28828 1110060G06Rik-201ENSMUST00000200372 499 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm44412-201ENSMUST00000203018 294 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm44296-201ENSMUST00000204689 681 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprmP28828 AC241593.2-201ENSMUST00000225099 510 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprmP28828 AC160962.1-203ENSMUST00000225167 1105 ntAPPRIS P5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprmP28828 AC154371.1-201ENSMUST00000226600 412 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Icos-201ENSMUST00000027162 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Olfr345-201ENSMUST00000076850 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm5416-201ENSMUST00000089628 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprmP28828 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
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