Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm15679-201ENSMUST00000161244 1936 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Olfr1165-ps-201ENSMUST00000117860 950 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Apc-ps1-201ENSMUST00000119356 470 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm12804-201ENSMUST00000121030 999 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm12755-201ENSMUST00000122297 282 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm24901-201ENSMUST00000158125 110 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm21726-201ENSMUST00000179654 392 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm29201-201ENSMUST00000189120 431 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm37455-201ENSMUST00000191993 529 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm42476-201ENSMUST00000198860 554 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm43368-201ENSMUST00000200638 409 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 AC091522.1-201ENSMUST00000213934 850 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps92-201ENSMUST00000220242 388 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm35558-203ENSMUST00000222264 204 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 CT009527.2-201ENSMUST00000225386 606 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Cst12-201ENSMUST00000028932 644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 n-R5s95-201ENSMUST00000082684 118 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 C2cd3-201ENSMUST00000051777 7803 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Ermap-206ENSMUST00000138395 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Atf7-211ENSMUST00000184906 1457 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm30292-201ENSMUST00000194198 3000 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm45322-201ENSMUST00000211642 1361 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Mbd5-202ENSMUST00000112745 6037 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm42483-201ENSMUST00000197556 1742 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
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Hoxd9P28357 Gm17916-201ENSMUST00000186137 1342 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 4930519E07Rik-201ENSMUST00000200907 1665 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm14594-201ENSMUST00000118052 537 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Klrc2-203ENSMUST00000118401 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm14590-201ENSMUST00000118934 537 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm12155-201ENSMUST00000121267 160 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Tex50-201ENSMUST00000135643 1192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm23583-201ENSMUST00000158533 289 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm14596-201ENSMUST00000180268 537 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm14595-201ENSMUST00000180335 537 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Trbv12-3-201ENSMUST00000192675 372 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm5050-201ENSMUST00000197164 775 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm44041-201ENSMUST00000203678 396 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
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