Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 1110057P08Rik-201ENSMUST00000089097 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Vmn2r60-201ENSMUST00000166447 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm38264-201ENSMUST00000194850 2032 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PtpraP18052 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Cd53-201ENSMUST00000038845 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm11042-201ENSMUST00000110441 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Olfr133-201ENSMUST00000113636 1090 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm14945-201ENSMUST00000119556 1118 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm13194-201ENSMUST00000142299 311 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 C130026I21Rik-207ENSMUST00000162421 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm24080-201ENSMUST00000175178 232 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Mir6539-201ENSMUST00000183732 110 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm8669-201ENSMUST00000183839 945 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm28153-201ENSMUST00000189853 629 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm38279-201ENSMUST00000194067 1131 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm43973-201ENSMUST00000203562 210 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm4057-201ENSMUST00000221407 368 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 AC154552.2-201ENSMUST00000223117 794 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Olfr917-201ENSMUST00000076542 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Csn1s1-201ENSMUST00000094641 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm10778-201ENSMUST00000105315 1497 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Tfpi-201ENSMUST00000028487 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm4767-201ENSMUST00000099439 1497 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm42905-201ENSMUST00000196237 1611 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpraP18052 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm38451-201ENSMUST00000208329 2646 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Olfr828-201ENSMUST00000104914 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm2348-201ENSMUST00000108782 300 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm15185-201ENSMUST00000117397 746 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm13607-201ENSMUST00000117875 539 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm13681-201ENSMUST00000117925 210 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm15490-201ENSMUST00000119894 387 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm13488-201ENSMUST00000120419 179 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm13007-201ENSMUST00000121866 365 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm11274-201ENSMUST00000146857 481 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm22794-201ENSMUST00000157228 306 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm23205-201ENSMUST00000158671 103 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm20456-201ENSMUST00000174690 385 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtpraP18052 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms