Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm37420-201ENSMUST00000195332 2912 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm10693-201ENSMUST00000144146 2037 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm13733-201ENSMUST00000117290 535 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm14909-201ENSMUST00000117853 351 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm12448-201ENSMUST00000118852 655 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm12186-201ENSMUST00000119050 945 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm2768-201ENSMUST00000121062 250 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm25781-201ENSMUST00000122527 84 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm11216-201ENSMUST00000125240 354 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm15017-201ENSMUST00000141989 632 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Fth-ps2-201ENSMUST00000168364 516 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm27636-201ENSMUST00000184528 122 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Sumo1-203ENSMUST00000185265 532 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm37586-201ENSMUST00000193654 204 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm43617-201ENSMUST00000196418 606 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm44431-201ENSMUST00000203500 413 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 4933430N04Rik-202ENSMUST00000208031 1146 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm18891-201ENSMUST00000216734 1087 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 AC160863.2-201ENSMUST00000218392 858 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 4930563J15Rik-203ENSMUST00000219796 574 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 CT030184.2-201ENSMUST00000223064 263 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 AC154506.1-201ENSMUST00000225178 621 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 AC138718.1-201ENSMUST00000225947 1009 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Olfr714-201ENSMUST00000054629 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r54-201ENSMUST00000058039 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm7646-201ENSMUST00000198590 1346 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 AC124556.1-201ENSMUST00000218256 1319 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Ankrd36-202ENSMUST00000109856 4491 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Zfp955a-201ENSMUST00000008830 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Olfr1085-203ENSMUST00000214566 5129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Olfr228-202ENSMUST00000217292 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Olfr1466-202ENSMUST00000207124 1981 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm11674-201ENSMUST00000124855 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Igkv6-20-201ENSMUST00000103388 375 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm14459-201ENSMUST00000115573 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm14987-201ENSMUST00000117820 676 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms