Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm3633-202ENSMUST00000163102 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Rpl9-ps5-201ENSMUST00000174221 571 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm28660-201ENSMUST00000186496 253 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm28389-201ENSMUST00000190090 697 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm37421-201ENSMUST00000193088 132 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Ighv3-4-201ENSMUST00000193408 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm44485-201ENSMUST00000199569 137 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm32536-201ENSMUST00000205209 445 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Snhg1-211ENSMUST00000206155 605 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm34066-201ENSMUST00000210156 825 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm32171-201ENSMUST00000217419 1043 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 5330434G04Rik-202ENSMUST00000136406 3545 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm37911-201ENSMUST00000193099 1545 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Vmn2r99-201ENSMUST00000176107 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Abi3bp-202ENSMUST00000096012 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Cnot1-201ENSMUST00000068452 8152 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm28183-201ENSMUST00000191321 1406 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 AC139218.1-201ENSMUST00000228215 4287 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 CT009734.1-201ENSMUST00000227657 1687 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 2810474O19Rik-208ENSMUST00000189837 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm42611-201ENSMUST00000199446 3407 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Ceacam2-201ENSMUST00000044547 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm19176-201ENSMUST00000222149 1831 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm14033-201ENSMUST00000128307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm6162-201ENSMUST00000194870 2930 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm23750-201ENSMUST00000104222 132 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm11912-201ENSMUST00000117235 264 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm12768-201ENSMUST00000120055 759 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Olfr1147-ps1-201ENSMUST00000122179 913 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm13738-201ENSMUST00000122437 469 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Tnfaip8-203ENSMUST00000126666 906 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 I0C0044D17Rik-202ENSMUST00000168045 510 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Znrd1as-203ENSMUST00000173814 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Mir6244-201ENSMUST00000184156 117 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm27409-201ENSMUST00000184727 80 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 1700028M03Rik-201ENSMUST00000185938 476 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm28149-201ENSMUST00000187102 378 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Mrgprb9-ps-201ENSMUST00000188739 892 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm28768-201ENSMUST00000189034 378 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm28883-201ENSMUST00000189256 369 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm18468-201ENSMUST00000207321 369 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm18470-201ENSMUST00000207467 420 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm18465-201ENSMUST00000207468 369 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm18464-201ENSMUST00000207803 420 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm18458-201ENSMUST00000207908 369 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm18461-201ENSMUST00000208421 420 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm45777-201ENSMUST00000213009 301 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 AC122395.1-201ENSMUST00000214666 374 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm8633-201ENSMUST00000218457 558 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Olfr151-202ENSMUST00000221099 929 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 AC164164.2-201ENSMUST00000221809 785 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Olfr266-201ENSMUST00000059486 1027 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Fbxw15-201ENSMUST00000056745 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 AC127371.2-201ENSMUST00000228108 1933 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Adgrg2-203ENSMUST00000112401 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Adgrg2-205ENSMUST00000112404 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Adgrg2-206ENSMUST00000112405 4634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm5591-201ENSMUST00000079759 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm10436-201ENSMUST00000071580 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Cmah-202ENSMUST00000110391 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm45644-201ENSMUST00000210255 2740 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Fat2-202ENSMUST00000108864 14423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Olfr1191-ps1-202ENSMUST00000217379 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Oxr1-202ENSMUST00000090095 4156 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Vmn1r32-202ENSMUST00000227014 2661 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Olfr293-202ENSMUST00000214401 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Trim12c-201ENSMUST00000059037 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm37115-201ENSMUST00000193750 2849 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Rgs17-202ENSMUST00000064225 8191 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Olfr1449-203ENSMUST00000214079 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Scaper-205ENSMUST00000217647 4370 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Slfn8-203ENSMUST00000108152 3083 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm23692-201ENSMUST00000101881 160 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm14836-201ENSMUST00000118567 471 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm4660-201ENSMUST00000131499 403 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm13173-201ENSMUST00000151703 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm22383-201ENSMUST00000158188 327 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Mir6906-201ENSMUST00000198998 58 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms