Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 1700060O08Rik-201ENSMUST00000185390 281 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 4930540E01Rik-201ENSMUST00000192569 1146 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 AC132315.1-201ENSMUST00000221771 390 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Sprr1b-201ENSMUST00000062160 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Olfr1053-201ENSMUST00000099897 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Zfp148-ps1-201ENSMUST00000211201 2453 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 AC170999.1-201ENSMUST00000226359 1585 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Dhrs9-201ENSMUST00000063690 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm33378-201ENSMUST00000219831 2758 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm37356-201ENSMUST00000193362 1613 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Olr1-201ENSMUST00000032265 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 AC166344.3-203ENSMUST00000228117 1466 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm13973-201ENSMUST00000121371 894 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm6647-201ENSMUST00000170514 641 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 A630095N17Rik-202ENSMUST00000180101 571 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm27414-201ENSMUST00000185033 381 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm29474-201ENSMUST00000187688 379 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 1700113H08Rik-203ENSMUST00000189775 798 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm8599-201ENSMUST00000193033 457 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 AC153370.1-201ENSMUST00000220296 635 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 AC121137.1-201ENSMUST00000225272 602 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 AC162183.1-202ENSMUST00000225434 904 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 AC136376.1-201ENSMUST00000228496 950 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 AC133189.2-201ENSMUST00000228527 392 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Iapp-201ENSMUST00000041993 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 AC158232.1-202ENSMUST00000218352 3343 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 AC130827.1-201ENSMUST00000220476 3850 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm14929-201ENSMUST00000152079 1850 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm1966-201ENSMUST00000184540 7293 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 AC123705.3-201ENSMUST00000223531 2069 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Pum2-210ENSMUST00000169089 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r1-201ENSMUST00000029406 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm37332-201ENSMUST00000195853 2844 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Sult2a5-201ENSMUST00000108525 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm22468-201ENSMUST00000116680 120 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm26248-201ENSMUST00000116700 121 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm26137-201ENSMUST00000116701 121 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm26190-201ENSMUST00000116704 121 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm24617-201ENSMUST00000116705 121 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm25778-201ENSMUST00000116713 121 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm25774-201ENSMUST00000116717 121 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm22102-201ENSMUST00000116730 121 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm23177-201ENSMUST00000116784 121 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm24193-201ENSMUST00000116801 121 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm24744-201ENSMUST00000116833 121 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm24427-201ENSMUST00000116896 121 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm22346-201ENSMUST00000116918 121 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm23606-201ENSMUST00000116938 121 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm22029-201ENSMUST00000116940 121 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm26298-201ENSMUST00000116956 121 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm23844-201ENSMUST00000116959 121 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm24484-201ENSMUST00000117009 121 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm25347-201ENSMUST00000117026 121 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm22112-201ENSMUST00000117032 121 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm13452-201ENSMUST00000120896 1097 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm23905-201ENSMUST00000157568 109 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm15790-201ENSMUST00000161109 1251 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm22991-201ENSMUST00000178126 121 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm25754-201ENSMUST00000178653 121 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms