Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm29154-234ENSMUST00000215272 750 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 AC159238.1-201ENSMUST00000220699 343 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm20368-201ENSMUST00000220716 301 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm23058-201ENSMUST00000093703 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Olfr618-201ENSMUST00000098197 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 A730004F24Rik-202ENSMUST00000195454 1704 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Slc22a27-201ENSMUST00000075619 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Mcf2-203ENSMUST00000101531 3671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm21693-202ENSMUST00000186047 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm3376-202ENSMUST00000186140 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm21704-202ENSMUST00000187277 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm10352-202ENSMUST00000187842 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm21677-202ENSMUST00000189592 1576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm38126-201ENSMUST00000195297 4003 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Adam25-201ENSMUST00000096663 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Olfr1406-202ENSMUST00000201132 2952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Olfr1263-202ENSMUST00000214382 4400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm11447-201ENSMUST00000118983 858 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm25176-201ENSMUST00000122640 125 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 2010013B24Rik-201ENSMUST00000126922 747 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 1700016G14Rik-201ENSMUST00000136906 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 A630023P12Rik-204ENSMUST00000142879 524 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Tmem216-206ENSMUST00000154383 927 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm22160-201ENSMUST00000158405 328 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm18342-201ENSMUST00000186987 694 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm2427-201ENSMUST00000189121 881 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm42458-201ENSMUST00000201914 369 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm44281-201ENSMUST00000203090 166 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm6828-201ENSMUST00000207902 1186 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 4930405G09Rik-201ENSMUST00000207912 1060 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Olfr1245-201ENSMUST00000214870 1062 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 AC156576.2-202ENSMUST00000222525 411 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 AL645546.2-201ENSMUST00000224526 265 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 AC165953.1-201ENSMUST00000226386 357 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Olfr1302-201ENSMUST00000054004 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Ube2dnl1-201ENSMUST00000059509 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm25139-201ENSMUST00000083247 210 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 AC144772.1-201ENSMUST00000226372 2398 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Olfr984-203ENSMUST00000214856 5025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Zfp931-201ENSMUST00000108923 1372 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm44220-201ENSMUST00000203784 2487 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm14139-202ENSMUST00000109929 1485 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Olfr362-202ENSMUST00000213817 4059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm42455-201ENSMUST00000199761 2736 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Vmn1r30-204ENSMUST00000228577 1968 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm6634-201ENSMUST00000180497 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Olfr487-202ENSMUST00000216489 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm42860-201ENSMUST00000196492 3991 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm37606-201ENSMUST00000191816 3116 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Defb30-201ENSMUST00000100490 307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Mir546-201ENSMUST00000102105 121 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Igkv10-95-201ENSMUST00000103329 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm13007-201ENSMUST00000121866 365 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm14840-201ENSMUST00000122135 594 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Nr6a1os-202ENSMUST00000151229 525 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Mir6400-201ENSMUST00000184870 92 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm43765-201ENSMUST00000196303 893 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm45502-201ENSMUST00000209561 252 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm18193-201ENSMUST00000210017 772 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm21041-201ENSMUST00000214829 823 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Mucl2-202ENSMUST00000226584 823 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 AC139294.2-201ENSMUST00000227159 285 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Olfr1341-201ENSMUST00000061215 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm28074-201ENSMUST00000190424 1497 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Olfr457-203ENSMUST00000204324 4275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms