Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cylc1-202ENSMUST00000210720 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr49-202ENSMUST00000216214 5717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44695-201ENSMUST00000205567 1631 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1444-202ENSMUST00000213606 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D7Ertd443e-202ENSMUST00000106129 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Obox2-204ENSMUST00000174305 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r-ps52-201ENSMUST00000177426 862 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43678-201ENSMUST00000197774 328 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45235-201ENSMUST00000208016 4465 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r32-201ENSMUST00000079584 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Amy2a5-201ENSMUST00000098673 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr473-202ENSMUST00000217618 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC116726.1-201ENSMUST00000215028 3497 ntBASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1268-ps1-201ENSMUST00000117787 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700091H14Rik-202ENSMUST00000185725 1388 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Egfros-201ENSMUST00000150329 4063 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr911-ps1-202ENSMUST00000216496 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ireb2-201ENSMUST00000034843 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cfap61-207ENSMUST00000138774 3308 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37212-201ENSMUST00000192582 3650 ntBASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37738-201ENSMUST00000192396 4716 ntBASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
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