Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Gm43921-201ENSMUST00000204296 1792 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 A230085B16Rik-201ENSMUST00000209781 1856 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Trpm8-202ENSMUST00000113114 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
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Hdac6Q9Z2V5 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
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Hdac6Q9Z2V5 Gm15443-201ENSMUST00000118947 820 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
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Hdac6Q9Z2V5 Gm14360-201ENSMUST00000120670 393 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 AC122858.3-202ENSMUST00000161721 433 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Spanxn4-201ENSMUST00000172433 424 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Gm23799-201ENSMUST00000175559 120 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Mir3090-201ENSMUST00000175597 87 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Gm18406-201ENSMUST00000185872 669 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Gm45658-201ENSMUST00000209197 580 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Olfr417-202ENSMUST00000217962 5662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
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Hdac6Q9Z2V5 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
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Hdac6Q9Z2V5 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
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Hdac6Q9Z2V5 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
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Hdac6Q9Z2V5 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Tsga10-207ENSMUST00000155852 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm37855-201ENSMUST00000192571 3700 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm16394-201ENSMUST00000117289 675 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm15126-201ENSMUST00000118631 833 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm5943-201ENSMUST00000119458 459 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm11359-201ENSMUST00000120039 567 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm13493-201ENSMUST00000120318 493 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Crem-236ENSMUST00000154715 1167 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 R3hcc1l-202ENSMUST00000160107 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm21654-201ENSMUST00000188086 691 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm43148-201ENSMUST00000198237 520 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm44316-201ENSMUST00000199274 97 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm7838-201ENSMUST00000203221 1189 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
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