Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm28474-201ENSMUST00000188501 315 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm31831-202ENSMUST00000198581 278 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm45316-201ENSMUST00000210128 162 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm45514-201ENSMUST00000211531 689 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm18113-201ENSMUST00000220630 303 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 AC141884.1-201ENSMUST00000226327 636 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 AC118639.1-204ENSMUST00000226401 694 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Prss23os-201ENSMUST00000032858 334 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Olfr1440-201ENSMUST00000054567 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Olfr1359-201ENSMUST00000077843 991 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Olfr168-201ENSMUST00000078554 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm23097-201ENSMUST00000083448 105 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Ubr4-201ENSMUST00000097822 15928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Olfr424-202ENSMUST00000214751 1642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Olfr1043-202ENSMUST00000213886 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm19074-201ENSMUST00000218915 1429 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Crisp2-201ENSMUST00000024724 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Olfr970-203ENSMUST00000215922 1739 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 AC115891.1-201ENSMUST00000215798 1755 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm42658-201ENSMUST00000197199 1575 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm11881-201ENSMUST00000119408 572 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm14534-201ENSMUST00000120045 357 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm13669-201ENSMUST00000122366 457 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm23501-201ENSMUST00000157744 256 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm10662-201ENSMUST00000168053 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm3727-201ENSMUST00000168458 995 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm6882-201ENSMUST00000177741 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm24315-201ENSMUST00000177835 127 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm5891-201ENSMUST00000179493 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm21614-201ENSMUST00000183260 1005 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Olfr1215-201ENSMUST00000188399 943 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm18296-201ENSMUST00000192475 783 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 AC117240.1-201ENSMUST00000199436 61 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm45850-201ENSMUST00000212536 338 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm20786-201ENSMUST00000212649 436 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm39363-201ENSMUST00000214251 723 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 AC145736.1-201ENSMUST00000214661 479 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 5330439M10Rik-201ENSMUST00000218667 348 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Tpbpb-202ENSMUST00000223698 746 ntAPPRIS P2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 CT025598.1-201ENSMUST00000225140 427 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm34240-201ENSMUST00000192500 1936 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm15328-201ENSMUST00000144006 2977 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm7155-201ENSMUST00000121143 1671 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130 ms