Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Mrgprb9-ps-201ENSMUST00000188739 892 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm28567-201ENSMUST00000190270 693 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm37485-201ENSMUST00000192326 2953 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm37044-201ENSMUST00000193531 693 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm5373-201ENSMUST00000212113 1050 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 CT030124.1-201ENSMUST00000217130 235 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm46191-201ENSMUST00000218899 433 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 AC154840.1-201ENSMUST00000225216 408 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Olfr720-201ENSMUST00000035250 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Ctsj-201ENSMUST00000071526 1271 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Trmt2b-201ENSMUST00000087540 822 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Dcun1d1-212ENSMUST00000198389 3020 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 AC133076.2-201ENSMUST00000227678 3532 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Rps12-ps26-201ENSMUST00000117751 333 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Bloc1s1-202ENSMUST00000131271 475 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 4930563I02Rik-202ENSMUST00000154835 971 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm16260-201ENSMUST00000155141 304 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm17023-201ENSMUST00000165885 448 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm28129-201ENSMUST00000186273 537 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm28957-201ENSMUST00000190174 373 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 4930478M09Rik-201ENSMUST00000201366 1113 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm8999-201ENSMUST00000204951 969 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 AC142273.1-201ENSMUST00000213723 673 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Aoah-202ENSMUST00000221982 919 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Tsga13-201ENSMUST00000048580 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Glipr1l1-201ENSMUST00000073617 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Csn2-201ENSMUST00000082370 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm24166-201ENSMUST00000082724 135 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Serpinb9g-201ENSMUST00000081927 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm19552-201ENSMUST00000194744 2833 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Serpinb9b-201ENSMUST00000006392 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Serpinb3b-202ENSMUST00000166100 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm42681-201ENSMUST00000197999 1611 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Mmp16-201ENSMUST00000029881 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Fbxl13-201ENSMUST00000051358 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Olfr1278-205ENSMUST00000215210 6901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 A230072E10Rik-202ENSMUST00000175825 3292 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm26745-201ENSMUST00000181022 1874 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm23948-201ENSMUST00000104030 132 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm23879-201ENSMUST00000116874 126 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Vmn1r57-201ENSMUST00000170780 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm29093-201ENSMUST00000187366 409 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 1700013M08Rik-201ENSMUST00000197709 683 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm19617-201ENSMUST00000202977 308 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm18791-201ENSMUST00000204611 726 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm31786-202ENSMUST00000212428 676 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 AC125399.1-201ENSMUST00000224236 595 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 AC133910.1-201ENSMUST00000228128 624 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Vmn1r5-202ENSMUST00000226130 3393 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 AC121870.1-201ENSMUST00000216279 4879 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Zfp329-202ENSMUST00000108546 2577 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Olfr1323-202ENSMUST00000213463 3717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm28832-201ENSMUST00000188603 1498 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm11910-201ENSMUST00000121624 432 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Rps10-ps3-201ENSMUST00000122317 500 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 1700015G11Rik-204ENSMUST00000190307 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm43418-201ENSMUST00000201334 428 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm2522-201ENSMUST00000204280 322 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm11360-201ENSMUST00000221898 262 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Olfr430-201ENSMUST00000055873 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 H2-M9-201ENSMUST00000087165 1125 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Lcor-202ENSMUST00000163929 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Vmn2r4-201ENSMUST00000170280 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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