Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RpainQ9CWY9 AC159238.1-201ENSMUST00000220699 343 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RpainQ9CWY9 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RpainQ9CWY9 AC124356.2-201ENSMUST00000221874 336 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RpainQ9CWY9 AC153794.2-201ENSMUST00000222650 550 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RpainQ9CWY9 Olfr577-201ENSMUST00000051505 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RpainQ9CWY9 Olfr480-201ENSMUST00000071658 1029 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RpainQ9CWY9 Olfr776-201ENSMUST00000073704 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RpainQ9CWY9 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RpainQ9CWY9 Olfr893-201ENSMUST00000093867 942 ntAPPRIS P2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RpainQ9CWY9 Gm10665-201ENSMUST00000098720 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RpainQ9CWY9 Gm10670-201ENSMUST00000098744 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RpainQ9CWY9 A330015K06Rik-202ENSMUST00000195685 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RpainQ9CWY9 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RpainQ9CWY9 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RpainQ9CWY9 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RpainQ9CWY9 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RpainQ9CWY9 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RpainQ9CWY9 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RpainQ9CWY9 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RpainQ9CWY9 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RpainQ9CWY9 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
RpainQ9CWY9 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
RpainQ9CWY9 Gm35842-201ENSMUST00000207859 4464 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
RpainQ9CWY9 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
RpainQ9CWY9 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
RpainQ9CWY9 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
RpainQ9CWY9 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.41
RpainQ9CWY9 Olfr380-202ENSMUST00000121209 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm24989-201ENSMUST00000104461 88 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm9732-201ENSMUST00000111874 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 B4galt4-202ENSMUST00000114708 734 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm10563-201ENSMUST00000115821 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Tcea1-ps1-201ENSMUST00000117942 904 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Olfr1144-ps1-201ENSMUST00000118227 328 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Xlr3e-ps-201ENSMUST00000119644 682 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Xlr3d-ps-201ENSMUST00000121687 658 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm16347-201ENSMUST00000131707 622 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm15632-201ENSMUST00000135936 246 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm12204-201ENSMUST00000147412 333 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm25342-201ENSMUST00000157459 122 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm8871-202ENSMUST00000168945 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm16430-201ENSMUST00000169006 615 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Rps19-ps12-201ENSMUST00000181937 430 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm27315-201ENSMUST00000183977 154 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm28889-201ENSMUST00000185350 959 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Smr3a-202ENSMUST00000189633 467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm28414-201ENSMUST00000190111 294 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 1700019A02Rik-202ENSMUST00000190748 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
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RpainQ9CWY9 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm42625-201ENSMUST00000198611 922 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Bc1-ps1-201ENSMUST00000208471 318 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm9373-201ENSMUST00000208724 599 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm38843-201ENSMUST00000209189 323 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm45639-201ENSMUST00000211205 710 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
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RpainQ9CWY9 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm45941-201ENSMUST00000221907 675 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 AV026068-237ENSMUST00000226075 572 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 AC122035.2-201ENSMUST00000228698 462 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Olfr1052-201ENSMUST00000054746 940 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Olfr1008-201ENSMUST00000054868 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Olfr827-201ENSMUST00000058123 1058 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Olfr1408-201ENSMUST00000073663 1037 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Mir465-201ENSMUST00000093563 74 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Olfr670-202ENSMUST00000214216 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm19113-201ENSMUST00000217552 1828 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm19176-201ENSMUST00000222149 1831 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm26535-201ENSMUST00000181602 2600 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 AC165273.1-201ENSMUST00000222780 2452 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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