Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r-ps109-201ENSMUST00000119308 725 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm14175-201ENSMUST00000119835 241 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 4930519F16Rik-202ENSMUST00000127012 685 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm11466-201ENSMUST00000148017 291 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm8358-201ENSMUST00000167222 555 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Vmn2r-ps32-201ENSMUST00000175794 757 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm29513-201ENSMUST00000185741 202 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm4035-201ENSMUST00000189445 399 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm44456-201ENSMUST00000196554 89 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm45247-201ENSMUST00000210757 309 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Olfr589-202ENSMUST00000218483 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 AC153961.2-201ENSMUST00000218877 164 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 AC154552.3-201ENSMUST00000220741 444 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 AC131117.2-203ENSMUST00000225886 950 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 AC125405.1-201ENSMUST00000226406 589 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Olfr589-201ENSMUST00000061055 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Olfr1276-201ENSMUST00000073322 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Olfr952-201ENSMUST00000073895 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm25099-201ENSMUST00000093716 116 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Olfr829-202ENSMUST00000212229 2590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm26893-202ENSMUST00000180965 2079 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm26552-202ENSMUST00000180980 2079 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm38451-201ENSMUST00000208329 2646 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Zfp120-203ENSMUST00000109931 4033 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Cdh10-202ENSMUST00000166873 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r184-206ENSMUST00000228145 5888 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm26835-201ENSMUST00000181888 3274 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm14569-204ENSMUST00000169499 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 AC115289.2-201ENSMUST00000223836 2803 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Ccr5-202ENSMUST00000111442 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Defb30-201ENSMUST00000100490 307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Ighv5-16-201ENSMUST00000103458 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm9427-201ENSMUST00000116187 651 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Spin2-ps1-201ENSMUST00000116643 875 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm6134-201ENSMUST00000117265 171 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm14833-201ENSMUST00000118345 1027 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm2288-201ENSMUST00000118560 638 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm14788-201ENSMUST00000119457 375 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm5405-201ENSMUST00000120478 609 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm12322-201ENSMUST00000121605 389 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm3757-201ENSMUST00000125878 675 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm14102-201ENSMUST00000147678 464 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm15230-201ENSMUST00000153701 510 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Spin2-ps6-201ENSMUST00000178459 525 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 1700027A15Rik-201ENSMUST00000185768 321 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 2010005H15Rik-202ENSMUST00000187183 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm28835-202ENSMUST00000189206 543 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm28189-201ENSMUST00000190085 571 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm28466-201ENSMUST00000190678 659 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Fbxw27-201ENSMUST00000197125 810 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm42926-201ENSMUST00000200496 697 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm2011-203ENSMUST00000203750 435 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm9278-201ENSMUST00000205508 553 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm7990-201ENSMUST00000212126 593 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 1700092E16Rik-201ENSMUST00000214766 753 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 AC153505.2-201ENSMUST00000217741 277 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 AC153870.1-201ENSMUST00000219599 560 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm4928-201ENSMUST00000219622 850 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 CT485612.1-201ENSMUST00000222555 382 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 AC158511.1-201ENSMUST00000223622 764 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim12aQ99PQ1 Gm6195-201ENSMUST00000063059 357 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms