Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9947-202ENSMUST00000187401 687 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28191-201ENSMUST00000189112 211 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29345-201ENSMUST00000189213 399 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm32051-201ENSMUST00000196818 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44319-201ENSMUST00000196974 93 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7443-201ENSMUST00000206355 378 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 AC160120.1-201ENSMUST00000227446 663 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28672-201ENSMUST00000188727 1490 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 AC123705.3-201ENSMUST00000223531 2069 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1242-204ENSMUST00000216001 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Brs3-201ENSMUST00000033464 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43469-201ENSMUST00000196084 4634 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 9630010A21Rik-201ENSMUST00000192348 2703 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 AC112972.2-201ENSMUST00000228702 2210 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc144b-201ENSMUST00000166644 1685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Senp7-203ENSMUST00000089362 4825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp951-201ENSMUST00000089906 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm22273-201ENSMUST00000104040 132 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr595-ps1-201ENSMUST00000118180 954 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14871-201ENSMUST00000119056 194 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9085-201ENSMUST00000119994 1072 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm24960-201ENSMUST00000157923 90 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r-ps57-201ENSMUST00000174879 288 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6882-201ENSMUST00000177741 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44300-201ENSMUST00000196792 121 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Mir703-201ENSMUST00000197105 109 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm19761-201ENSMUST00000205372 391 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18205-201ENSMUST00000209215 841 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45659-201ENSMUST00000209295 564 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7435-201ENSMUST00000214039 486 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18541-201ENSMUST00000215935 538 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Lrrc72-203ENSMUST00000221155 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Sprr3-201ENSMUST00000058142 1222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Tas2r129-201ENSMUST00000070991 965 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr98-201ENSMUST00000080759 1039 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43613-201ENSMUST00000199409 1613 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm1720-201ENSMUST00000135086 1503 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Cyp4a32-201ENSMUST00000084342 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Homer2-202ENSMUST00000098326 10982 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r21-203ENSMUST00000226191 1669 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8267-203ENSMUST00000226900 1592 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr183-204ENSMUST00000214831 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 AL591843.1-201ENSMUST00000223686 3082 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm25313-201ENSMUST00000101817 116 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11708-201ENSMUST00000119530 832 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12880-201ENSMUST00000120652 494 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11804-201ENSMUST00000121663 468 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11233-201ENSMUST00000122357 634 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm22106-201ENSMUST00000122544 127 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm25430-201ENSMUST00000157614 289 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm23287-201ENSMUST00000179427 116 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm23143-201ENSMUST00000180137 116 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18303-201ENSMUST00000190055 1176 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms