Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Gm27022-201ENSMUST00000183225 715 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm37220-201ENSMUST00000195179 415 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm43444-201ENSMUST00000198123 291 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Olfr519-202ENSMUST00000202706 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm45777-201ENSMUST00000213009 301 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm7435-201ENSMUST00000214039 486 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 AC161884.2-201ENSMUST00000224513 227 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 CT010486.1-201ENSMUST00000224609 422 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 AC154583.1-201ENSMUST00000224788 655 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 AC170999.2-201ENSMUST00000226223 264 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm23623-201ENSMUST00000082461 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Vmn2r115-201ENSMUST00000168175 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Olfr1305-203ENSMUST00000213737 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm42798-201ENSMUST00000200853 3972 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 G930045G22Rik-201ENSMUST00000101402 480 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm23294-201ENSMUST00000104150 164 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm15152-201ENSMUST00000121540 394 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm15141-201ENSMUST00000121860 729 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm14713-201ENSMUST00000122362 686 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm13062-201ENSMUST00000151337 562 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm26086-201ENSMUST00000157902 263 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm15812-201ENSMUST00000162331 748 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm17164-201ENSMUST00000169013 506 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm8890-202ENSMUST00000177727 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm8926-202ENSMUST00000178158 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm8879-202ENSMUST00000178863 465 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm8922-202ENSMUST00000178989 465 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Speer1-202ENSMUST00000179482 465 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm8897-202ENSMUST00000179679 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm27849-201ENSMUST00000183673 125 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm29534-201ENSMUST00000187328 382 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm21654-201ENSMUST00000188086 691 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm42610-201ENSMUST00000196557 650 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm6260-202ENSMUST00000197170 921 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm6543-201ENSMUST00000197353 808 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm9332-201ENSMUST00000198431 730 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm43345-201ENSMUST00000199484 269 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm2762-205ENSMUST00000202366 356 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm45474-201ENSMUST00000209471 408 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm33601-201ENSMUST00000210001 961 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm45870-201ENSMUST00000211269 601 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Cyp3a61-ps1-201ENSMUST00000218470 592 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Olfr1200-201ENSMUST00000099811 1011 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 1700017N19Rik-204ENSMUST00000188736 1709 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Ube2u-202ENSMUST00000133493 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Esp31-201ENSMUST00000174742 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Olfr1281-202ENSMUST00000208176 4905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Agbl2-202ENSMUST00000037219 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Hyal5-201ENSMUST00000031689 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm15337-201ENSMUST00000135378 3888 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm37738-201ENSMUST00000192396 4716 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm23942-201ENSMUST00000101956 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Igkv4-92-201ENSMUST00000103332 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Glrb-202ENSMUST00000107743 1101 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm14871-201ENSMUST00000119056 194 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm12650-201ENSMUST00000121966 258 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm15589-201ENSMUST00000144193 271 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm15892-201ENSMUST00000152627 439 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm11339-201ENSMUST00000154766 490 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm22339-201ENSMUST00000157718 62 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Adgrg4-206ENSMUST00000168724 531 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Vmn2r-ps126-201ENSMUST00000176711 1149 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Arhgap39-209ENSMUST00000177026 371 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm21915-201ENSMUST00000177787 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm28706-201ENSMUST00000186830 355 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms