Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Dlx6os1-201ENSMUST00000159568 4608 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp182-201ENSMUST00000040628 2487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Fpgt-201ENSMUST00000066568 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5715-201ENSMUST00000196854 1465 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Zfhx4-205ENSMUST00000176383 13500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Spam1-201ENSMUST00000031693 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr457-203ENSMUST00000204324 4275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Ktn1-221ENSMUST00000190535 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23594-201ENSMUST00000104307 134 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15772-201ENSMUST00000118533 438 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11822-201ENSMUST00000119177 415 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12466-201ENSMUST00000121199 620 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26034-201ENSMUST00000158154 116 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26404-201ENSMUST00000158498 109 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26579-201ENSMUST00000181656 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37632-201ENSMUST00000191811 1142 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2622-201ENSMUST00000200018 471 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43968-201ENSMUST00000203388 389 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8719-201ENSMUST00000203602 534 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem209-211ENSMUST00000222934 1212 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29048-202ENSMUST00000190399 1601 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 AC187103.2-201ENSMUST00000223605 1617 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Rabgap1-202ENSMUST00000066055 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Fam26d-201ENSMUST00000048052 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19666-201ENSMUST00000198176 1893 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1416-202ENSMUST00000214928 4838 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 4930532I03Rik-201ENSMUST00000218463 1724 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Ush2a-201ENSMUST00000060479 15695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24170-201ENSMUST00000104124 133 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13371-201ENSMUST00000137756 469 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26310-201ENSMUST00000157766 117 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26950-201ENSMUST00000182734 498 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43418-201ENSMUST00000201334 428 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm31510-202ENSMUST00000206795 239 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45615-201ENSMUST00000210417 656 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 AC109180.1-201ENSMUST00000218676 398 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Selenok-ps6-201ENSMUST00000221812 283 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 AC125543.1-201ENSMUST00000222778 101 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r110-201ENSMUST00000169559 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Dram2-201ENSMUST00000029507 1891 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42549-201ENSMUST00000202392 7004 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Tenm1-202ENSMUST00000115058 12837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1389-202ENSMUST00000216641 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44751-201ENSMUST00000208302 4387 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Vsig4-201ENSMUST00000050707 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Mbnl1-214ENSMUST00000193517 5151 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11633-201ENSMUST00000118176 444 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5391-201ENSMUST00000121155 613 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13147-201ENSMUST00000125785 585 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12114-201ENSMUST00000147896 656 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27016-201ENSMUST00000183294 715 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29086-201ENSMUST00000186774 222 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29085-201ENSMUST00000187108 225 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9569-201ENSMUST00000187492 787 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28769-201ENSMUST00000190176 615 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8189-203ENSMUST00000211159 1225 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 AC158803.3-201ENSMUST00000220024 211 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr870-202ENSMUST00000215984 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 A230072E10Rik-202ENSMUST00000175825 3292 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43784-201ENSMUST00000202922 2436 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37606-201ENSMUST00000191816 3116 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Akap4-202ENSMUST00000115750 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 3222401L13Rik-202ENSMUST00000192137 6292 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4166-201ENSMUST00000220893 2996 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 CT025710.1-201ENSMUST00000222949 2533 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6647-201ENSMUST00000170514 641 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms