Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Ak9-201ENSMUST00000173494 6968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Olfr75-ps1-201ENSMUST00000135477 938 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 5730412P04Rik-201ENSMUST00000147100 1149 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm42564-201ENSMUST00000196013 582 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Amelx-201ENSMUST00000066112 802 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm7416-201ENSMUST00000117448 1487 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Agl-208ENSMUST00000162792 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.77
NipblQ6KCD5 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Otc-202ENSMUST00000115528 2997 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm37077-201ENSMUST00000195723 3691 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Olfr473-202ENSMUST00000217618 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm24170-201ENSMUST00000104124 133 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm25572-201ENSMUST00000157527 172 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 AI506816-203ENSMUST00000198461 503 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 AC121912.1-201ENSMUST00000227525 1201 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Olfr552-201ENSMUST00000098223 954 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm30524-201ENSMUST00000204271 2300 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm37283-201ENSMUST00000193111 1571 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 AC156636.1-201ENSMUST00000218639 2229 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Fat1-201ENSMUST00000098796 14627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm6884-201ENSMUST00000119318 615 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm23354-201ENSMUST00000158426 104 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm24739-201ENSMUST00000158855 292 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm20428-201ENSMUST00000174365 283 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm29532-201ENSMUST00000185593 622 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm29504-201ENSMUST00000185605 537 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm29360-201ENSMUST00000185625 537 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm28296-202ENSMUST00000186151 622 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm29498-201ENSMUST00000186449 537 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm28565-202ENSMUST00000186615 537 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm28297-201ENSMUST00000186679 537 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm28326-201ENSMUST00000187043 622 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm28301-201ENSMUST00000187582 537 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm28464-201ENSMUST00000187726 622 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm29286-202ENSMUST00000187736 537 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm28295-201ENSMUST00000188322 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm29578-201ENSMUST00000188809 537 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm29166-202ENSMUST00000189600 537 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm28765-201ENSMUST00000189752 537 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm28617-202ENSMUST00000190129 537 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm28522-202ENSMUST00000190561 537 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm28834-202ENSMUST00000190714 537 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm28987-201ENSMUST00000191071 537 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm29132-202ENSMUST00000191588 622 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm30174-201ENSMUST00000191682 537 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm36261-201ENSMUST00000191807 537 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm34550-202ENSMUST00000195186 537 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm2623-201ENSMUST00000199229 286 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm5045-201ENSMUST00000027054 810 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm24763-201ENSMUST00000083688 190 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Virma-202ENSMUST00000059914 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Fam205c-201ENSMUST00000055944 1655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Ptgs2-201ENSMUST00000035065 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm22468-201ENSMUST00000116680 120 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm26248-201ENSMUST00000116700 121 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm26137-201ENSMUST00000116701 121 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm26190-201ENSMUST00000116704 121 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm24617-201ENSMUST00000116705 121 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm25778-201ENSMUST00000116713 121 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm25774-201ENSMUST00000116717 121 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm22102-201ENSMUST00000116730 121 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm23177-201ENSMUST00000116784 121 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm24193-201ENSMUST00000116801 121 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm24744-201ENSMUST00000116833 121 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm24427-201ENSMUST00000116896 121 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm22346-201ENSMUST00000116918 121 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm23606-201ENSMUST00000116938 121 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm22029-201ENSMUST00000116940 121 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm26298-201ENSMUST00000116956 121 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm23844-201ENSMUST00000116959 121 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm24484-201ENSMUST00000117009 121 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm25347-201ENSMUST00000117026 121 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Gm22112-201ENSMUST00000117032 121 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NipblQ6KCD5 Olfr404-ps1-201ENSMUST00000121065 972 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
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