Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm12762-201ENSMUST00000140881 483 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm24363-201ENSMUST00000158440 311 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm19131-201ENSMUST00000203408 789 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm45910-201ENSMUST00000212493 1003 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 AC146601.1-201ENSMUST00000227910 905 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm24031-201ENSMUST00000083930 131 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Olfr1200-201ENSMUST00000099811 1011 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Smc5-206ENSMUST00000226111 3265 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm28673-201ENSMUST00000186562 1498 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm37344-203ENSMUST00000195490 1498 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Zfp984-202ENSMUST00000122309 2405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Angel2-201ENSMUST00000027947 3562 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Snhg14-214ENSMUST00000191191 3991 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Pus10-203ENSMUST00000109525 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm21704-201ENSMUST00000169382 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Olfr402-202ENSMUST00000216722 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Olfr132-202ENSMUST00000216804 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm14908-201ENSMUST00000120930 1286 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm15075-201ENSMUST00000122187 477 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Olfr405-ps1-202ENSMUST00000127098 711 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 4930547E08Rik-201ENSMUST00000143559 541 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Mir6344-201ENSMUST00000183462 104 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 AC156576.2-202ENSMUST00000222525 411 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 AC154283.1-201ENSMUST00000228417 389 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm10491-201ENSMUST00000085330 117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Nlrp9b-201ENSMUST00000073151 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Ak9-201ENSMUST00000173494 6968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 AC107645.1-201ENSMUST00000228660 1810 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Xpo7-203ENSMUST00000226448 3663 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm37607-201ENSMUST00000194925 2623 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Ubqlnl-201ENSMUST00000059121 2298 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Obox4-ps27-201ENSMUST00000179203 1362 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Olfr270-204ENSMUST00000215127 3145 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Akr1c14-202ENSMUST00000118717 3183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 AC125095.1-201ENSMUST00000228387 2020 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm6503-201ENSMUST00000210829 2225 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm11914-201ENSMUST00000117094 507 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm11699-201ENSMUST00000119016 401 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm14742-201ENSMUST00000148284 381 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 1700015G11Rik-204ENSMUST00000190307 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm18181-201ENSMUST00000190670 736 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm44648-201ENSMUST00000208267 329 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 AC159821.1-201ENSMUST00000214934 248 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Gm23928-201ENSMUST00000082469 145 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
Ccdc18Q640L5 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Akap4-202ENSMUST00000115750 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm37890-201ENSMUST00000195610 3992 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm44250-201ENSMUST00000203092 4229 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Eya4-208ENSMUST00000220299 3615 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 AC131329.1-201ENSMUST00000221204 3487 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Olfr55-203ENSMUST00000214891 4428 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm7312-201ENSMUST00000118798 469 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm13220-201ENSMUST00000121535 508 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm29138-201ENSMUST00000191444 348 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Rho-205ENSMUST00000203877 939 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 AC121599.1-201ENSMUST00000224276 449 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 AC154788.1-201ENSMUST00000225003 340 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 CT025552.2-201ENSMUST00000225497 317 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.6 ms