Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm38015-201ENSMUST00000193048 188 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm29813-201ENSMUST00000195856 447 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm43005-201ENSMUST00000199015 648 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 AC158807.1-201ENSMUST00000217959 187 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Olfr968-201ENSMUST00000075928 1027 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1016-201ENSMUST00000099915 930 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 9330158H04Rik-201ENSMUST00000101535 3174 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r5-203ENSMUST00000228276 3188 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm21119-201ENSMUST00000178438 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r34-206ENSMUST00000228498 3078 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm45324-201ENSMUST00000211193 5638 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm44532-201ENSMUST00000207723 2598 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Cdh19-201ENSMUST00000094626 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1440-205ENSMUST00000216145 7542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Cybb-201ENSMUST00000015484 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm5746-201ENSMUST00000183550 2200 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm43162-201ENSMUST00000198292 1770 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1131-203ENSMUST00000216756 1459 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r213-203ENSMUST00000228031 3367 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Kcnb2-201ENSMUST00000170146 14845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Olfr995-202ENSMUST00000216933 1706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 AC091683.1-201ENSMUST00000222307 2446 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm8005-201ENSMUST00000167326 1401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm22371-201ENSMUST00000104588 130 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Bpifc-202ENSMUST00000105304 451 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm13250-201ENSMUST00000117209 753 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm15388-201ENSMUST00000121578 726 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm11759-201ENSMUST00000121742 464 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Scgb2b23-ps-201ENSMUST00000122094 330 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm15212-201ENSMUST00000122403 466 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm25553-201ENSMUST00000158076 79 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm4222-201ENSMUST00000165784 470 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm42936-201ENSMUST00000174019 652 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm20690-201ENSMUST00000177341 315 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm16531-201ENSMUST00000180658 967 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm27528-201ENSMUST00000183544 205 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm10048-201ENSMUST00000194196 372 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm37908-201ENSMUST00000195828 470 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 AC122464.1-201ENSMUST00000202789 770 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm44768-201ENSMUST00000205719 393 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm34066-201ENSMUST00000210156 825 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 AC159629.1-201ENSMUST00000220698 568 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 AC137871.3-201ENSMUST00000226628 225 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 AC160120.1-201ENSMUST00000227446 663 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Fam183b-201ENSMUST00000060581 493 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Olfr741-201ENSMUST00000071932 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Mir199a-2-201ENSMUST00000093618 110 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Abca16-201ENSMUST00000056042 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r72-203ENSMUST00000227010 6279 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 AC115760.1-201ENSMUST00000225160 1327 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Ano5-203ENSMUST00000207717 2753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Cd226-201ENSMUST00000037142 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r5-202ENSMUST00000226130 3393 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1016-203ENSMUST00000217410 2738 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm37964-201ENSMUST00000192459 4905 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Olfr26-201ENSMUST00000104874 931 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm14221-201ENSMUST00000109473 340 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm12564-201ENSMUST00000119860 321 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm13902-201ENSMUST00000120168 605 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm15791-201ENSMUST00000120365 319 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm7746-201ENSMUST00000120966 503 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm14649-201ENSMUST00000121814 324 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm25806-201ENSMUST00000122782 122 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Olfr723-201ENSMUST00000164157 1006 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm27185-201ENSMUST00000184296 247 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Mocs2-217ENSMUST00000184781 1250 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm2914-201ENSMUST00000186120 328 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm28871-201ENSMUST00000186191 687 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm37359-201ENSMUST00000195243 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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