Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Vmn2r89-201ENSMUST00000159611 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Vmn1r204-202ENSMUST00000228195 2936 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Themis-202ENSMUST00000060409 2278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 C230085N15Rik-201ENSMUST00000194893 4327 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Olfr359-ps1-201ENSMUST00000115977 926 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm14788-201ENSMUST00000119457 375 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Smt3h2-ps-201ENSMUST00000121084 285 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm15877-201ENSMUST00000121897 964 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Olfr213-201ENSMUST00000121958 984 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm14637-201ENSMUST00000156516 444 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Vmn1r103-201ENSMUST00000163461 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Vmn1r151-201ENSMUST00000166079 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm17206-201ENSMUST00000168123 577 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm20453-201ENSMUST00000173968 226 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm10074-201ENSMUST00000174543 249 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps4-201ENSMUST00000176989 1015 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm19427-201ENSMUST00000183619 208 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Mir7008-201ENSMUST00000184398 63 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 1700054K19Rik-201ENSMUST00000186102 452 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm29610-201ENSMUST00000187749 453 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Igkv4-75-201ENSMUST00000197204 359 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm36840-201ENSMUST00000202688 250 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm45026-201ENSMUST00000205292 833 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm33248-202ENSMUST00000206954 486 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 AC154851.2-201ENSMUST00000222172 644 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Klra7-203ENSMUST00000088011 921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Olfr552-201ENSMUST00000098223 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Olfr1180-201ENSMUST00000099824 1063 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Olfr1160-201ENSMUST00000099839 960 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 C87499-203ENSMUST00000107143 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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Sh3bp1P55194 Ccr5-202ENSMUST00000111442 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm30292-201ENSMUST00000194198 3000 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm36951-201ENSMUST00000193840 2687 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 B130011K05Rik-201ENSMUST00000151765 3270 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Ankrd49-202ENSMUST00000214456 3207 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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Sh3bp1P55194 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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Sh3bp1P55194 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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Sh3bp1P55194 Nlrp4e-201ENSMUST00000076470 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Olfr1499-202ENSMUST00000216659 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Slc31a1-202ENSMUST00000122092 4154 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm42600-201ENSMUST00000202081 3588 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 5830405F06Rik-201ENSMUST00000192753 1755 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm14295-202ENSMUST00000132883 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 AC159476.1-201ENSMUST00000215914 1668 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Ndst4-205ENSMUST00000174648 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm15660-201ENSMUST00000118997 478 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
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