Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm43580-201ENSMUST00000202892 284 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VdrP48281 Olfr1088-ps1-201ENSMUST00000213686 863 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
VdrP48281 Olfr1075-ps1-201ENSMUST00000214201 470 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
VdrP48281 AC122188.1-201ENSMUST00000217534 312 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
VdrP48281 AC153382.1-201ENSMUST00000217953 1007 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VdrP48281 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VdrP48281 AC138667.2-201ENSMUST00000224880 598 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
VdrP48281 AL606513.1-201ENSMUST00000225369 579 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
VdrP48281 AC115735.5-201ENSMUST00000228386 397 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
VdrP48281 AC109172.2-201ENSMUST00000228792 381 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
VdrP48281 Bcl2a1c-201ENSMUST00000066460 444 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VdrP48281 Olfr385-201ENSMUST00000071553 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VdrP48281 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
VdrP48281 Olfr381-201ENSMUST00000078358 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VdrP48281 Olfr168-201ENSMUST00000078554 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VdrP48281 Olfr1360-201ENSMUST00000079135 980 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm22265-201ENSMUST00000082947 116 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
VdrP48281 Fanci-201ENSMUST00000036865 4645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VdrP48281 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
VdrP48281 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
VdrP48281 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
VdrP48281 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VdrP48281 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
VdrP48281 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
VdrP48281 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
VdrP48281 Fpgt-201ENSMUST00000066568 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
VdrP48281 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VdrP48281 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm44742-201ENSMUST00000207190 1412 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 Tex35-202ENSMUST00000118207 912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm12891-201ENSMUST00000119358 240 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 Crem-224ENSMUST00000147138 436 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm22076-201ENSMUST00000158601 84 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm42936-201ENSMUST00000174019 652 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm19203-201ENSMUST00000174049 939 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 Vmn1r-ps151-201ENSMUST00000176956 982 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 Smr3a-202ENSMUST00000189633 467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm37756-201ENSMUST00000191834 942 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 Ltf-209ENSMUST00000198884 616 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 Igkv14-134-1-201ENSMUST00000199111 331 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm18452-201ENSMUST00000202968 1111 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 Olfr529-ps1-201ENSMUST00000211097 928 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm18225-201ENSMUST00000216708 742 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 AC153852.1-201ENSMUST00000217881 567 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 AC091764.3-201ENSMUST00000219646 300 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm18026-201ENSMUST00000222789 727 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 Il18-201ENSMUST00000059081 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 4930522H14Rik-201ENSMUST00000082306 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 4921515E04Rik-203ENSMUST00000227364 2309 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 Olfr196-202ENSMUST00000205471 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm28183-201ENSMUST00000191321 1406 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 Olfr1505-202ENSMUST00000216623 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
VdrP48281 Skint4-201ENSMUST00000069769 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Pih1h3b-201ENSMUST00000044806 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 AC167013.5-201ENSMUST00000227597 2947 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm14904-201ENSMUST00000117067 335 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Olfr1165-ps-201ENSMUST00000117860 950 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm14731-201ENSMUST00000119216 376 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm11352-201ENSMUST00000119264 517 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm5942-201ENSMUST00000120046 439 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm6031-201ENSMUST00000121314 1054 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm11438-201ENSMUST00000121582 189 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm22199-201ENSMUST00000122660 126 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm13599-201ENSMUST00000134476 678 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms