Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Zfp967-202ENSMUST00000178443 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Zfp969-203ENSMUST00000179061 1458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Pcdh17-201ENSMUST00000071370 11451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Chrm2-202ENSMUST00000172278 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Il1rl1-203ENSMUST00000173514 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 AC124446.1-201ENSMUST00000221027 2644 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Ankrd6-203ENSMUST00000084749 4573 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Mir763-201ENSMUST00000103249 120 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm15586-201ENSMUST00000121218 528 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm14742-201ENSMUST00000148284 381 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 4930505K14Rik-201ENSMUST00000155504 515 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Rpain-210ENSMUST00000167509 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm20630-201ENSMUST00000177387 551 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Vmn2r-ps34-201ENSMUST00000177433 904 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm21809-201ENSMUST00000178495 468 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm9830-201ENSMUST00000178509 357 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm17467-201ENSMUST00000178553 468 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Nutf2-ps2-201ENSMUST00000179225 384 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm17412-201ENSMUST00000179261 468 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm17577-201ENSMUST00000179916 468 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm6712-202ENSMUST00000186431 526 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm18553-201ENSMUST00000194152 634 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Ighv1-17-201ENSMUST00000194435 350 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm37585-201ENSMUST00000195440 280 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm42623-201ENSMUST00000197225 379 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Hax1-204ENSMUST00000197725 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm43021-201ENSMUST00000198692 337 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm43710-201ENSMUST00000199583 452 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm42750-201ENSMUST00000199745 353 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm40304-201ENSMUST00000202154 268 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm19726-201ENSMUST00000205008 240 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 LOC665443-201ENSMUST00000212284 796 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 AC152415.1-201ENSMUST00000213320 440 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm32443-201ENSMUST00000217880 707 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 AC122367.2-201ENSMUST00000220987 534 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm46323-201ENSMUST00000223136 628 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 AC154649.2-201ENSMUST00000228189 808 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 AC161537.1-202ENSMUST00000228450 868 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Olfr437-201ENSMUST00000060243 1018 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Rpl31-ps20-201ENSMUST00000080982 378 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm9386-201ENSMUST00000095195 381 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm10033-201ENSMUST00000072427 1813 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Brd8-202ENSMUST00000097626 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Klhl5-201ENSMUST00000101191 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Ezh1-202ENSMUST00000107284 4207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Plau-201ENSMUST00000022368 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gas2l3-201ENSMUST00000099374 6748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Crb1-204ENSMUST00000198445 6135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Trim2-202ENSMUST00000065380 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm13619-201ENSMUST00000155722 2138 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm8844-201ENSMUST00000119460 2614 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Lonp2-202ENSMUST00000121673 1550 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Cpvl-203ENSMUST00000204674 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm37080-201ENSMUST00000194804 2404 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Pabpc4l-202ENSMUST00000192793 5252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Atf2-201ENSMUST00000055833 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Zfp961-201ENSMUST00000109997 2713 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Cav1-202ENSMUST00000115453 2746 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm37745-201ENSMUST00000193304 8163 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Emsy-201ENSMUST00000038359 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm37520-201ENSMUST00000194883 2672 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm15526-201ENSMUST00000112504 204 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm12306-201ENSMUST00000117256 171 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm15054-201ENSMUST00000117393 281 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm12677-201ENSMUST00000118668 426 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Kxd1-203ENSMUST00000118850 992 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm13466-201ENSMUST00000121515 999 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm12293-201ENSMUST00000121898 590 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm25106-201ENSMUST00000122672 134 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm24997-201ENSMUST00000157910 105 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 U2af1l4-204ENSMUST00000163464 651 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm17148-201ENSMUST00000164702 249 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm3173-203ENSMUST00000166848 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms